@article { author = {Ahmadi, Nahid and Rahnema, Hassan and Kazemi Tabar, Seyyed kamal}, title = {Cloning of tomato E8 promoter and its analysis in transient assays using Agro-infilteration system}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {1-14}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1162}, abstract = {Isolation and characterization of fruit specific promoters is important for manipulation and targeted expression of recombinant proteins in plants. E8 is a fruit specific promoter with 2.2 kb length. In this study, a 1.1 kb core part of E8 promoter was used. The amplification of the E8 promoter was conducted using specific primers and pfu polymerase by Polymerase Chain Reaction (PCR). After sequencing of E8 promoter for its confirmation, the CaMV35S promoter in pBI121 binary vector replaced by E8 promoter. The recombinant plasmid pBI-E8-GUS was transfered to Agrobacterium tumefaciens LBA4404 by using freeze-thaw method. The specific expression of gus gene in tomato tissue was evaluated using Agro-infiltration method. Agrobacterium harboring pBI121 was used as control. The results showed that gus gene can express specifically in tomato fruits under the control of E8 promoter. Therefore, E8 promoter can be used for tissue specific expression of recombinant protein in the fruit of tomato plants.}, keywords = {Agro-infiltration,E8 promoter,Tissue specific,Tomato,Transient expression}, title_fa = {همسانه سازی پیشبر E8 گیاه گوجه فرنگی و بررسی بیان موقت با استفاده از سیستم اگرواینفیلتریشن}, abstract_fa = {جداسازی و بررسی خصوصیات پیشبرهای اختصاصی بافت میوه،  برای دستورزی و بیان هدفمند پروتئین­های نوترکیب در گیاهان از اهمیت زیادی برخوردار است. پیشبر E8 یک پیشبر اختصاصی بافت میوه گیاه گوجه­فرنگی بوده که طول کامل آن kb 2/2 می­باشد. در این پژوهش بخش هسته­ای این پیشبر به طول kb 1/1 مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از پرایمرهای اختصاصی و آنزیم pfu پلیمراز، قطعه مورد نظر از روی DNA استخراج شده گوجه فرنگی تکثیر و همسانه­سازی شد. پس از تعیین توالی و تایید نهایی، پیشبر E8 جایگزین پیشبر دایمی CaMV35S در ناقل دوگانه pBI121 گردید. پلاسمید نوترکیب با کمک شوک حرارتی به Agrobacterium tumefaciens سویه LBA4404 منتقل شد. با استفاده از روش اگرواینفیلتریشن بیان اختصاصی ژن gus در بافت­های گیاه گوجه­فرنگی مورد بررسی قرار گرفت. اگروباکتریوم حاوی ناقل دوگانه pBI121 به عنوان کنترل مورد استفاده قرار گرفت. نتایج حاصل نشان داد که ژن gus در میوه­های گوجه فرنگی به طور اختصاصی بیان می­شود. از این پیشبر فعال می­توان برای بیان اختصاصی پروتئین­های نوترکیب در میوه­های گیاه گوجه فرنگی استفاده نمود.}, keywords_fa = {اگرواینفیلتریشن,بیان موقت,پیشبر E8,گوجه فرنگی,gus}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1162.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1162_9ed648254f6d320feadff95b8aa1afb2.pdf} } @article { author = {Khezri, Amin and Yousefi Ansari, Mohsen and Mohammad Aabdi, Mohammad Reza}, title = {Analysis the protein subunits and fractions of almond meal in comparison to soybean meal and cottonseed meal using SDS-Page electrophoresis and CNCPS method}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {15-26}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1163}, abstract = {             To study the protein subunits and fractions of almond meal in comparison to soybean meal and cottonseed meal, two methods including SDS-Page electrophoresis and CNCPS were used in this research. The results of protein fractions according to CNCPS shows a significant difference (p<0.05) among non-protein nitrogen (A), rapidly degradable true protein (B1), moderately degradable true protein (B2), slowly degradable true protein (B3) and undegradable true protein (C) fractions of almond meal in comparison to soybean meal and cottonseed meal. In regards to SDS-Page electrophoresis results, amandin protein was mainly composed of two major polypeptides with estimated MWs in the range 63-100 kDa (acidic polypeptides) and 20-35 kDa (basic polypeptides). Furthermore, two major polypeptides including β-Conglycinin (three subunits, α, ά, β with MWs of 91.83, 80.49 and 47.16 respectively) and glycinin (two acidic and basic subunits with MWs of 40 and 21.30 kDa respectively) were observed in soybean meal. The pattern of protein subunits in cottonseed meal shows four major polypeptides including Globulin 9S (with MWs of 78.36 and 71.10 kDa), Globulin 5S (with MW of 25.47 kDa) and Albumin 2S (with MW of 15.84 kDa). The results of the current study shows that almond meal have a good nutritive value and can be a good substitute for soybean meal in animal nutrition.}, keywords = {Almond meal,Protein subunits,SDS-Page electrophoresis,CNCPS}, title_fa = {بررسی زیر واحدها و بخش های مختلف پروتئین کنجاله بادام در مقایسه با کنجاله های سویا و پنبه دانه با استفاده از روش های الکتروفورز SDS-PAGE و CNCPS}, abstract_fa = {در این پژوهش به منظور مطالعه زیر واحدها و بخش های مختلف پروتئین کنجاله بادام و مقایسه آن با کنجاله های سویا و پنبه دانه از دو روش الکتروفورز SDS-PAGE و روش CNCPS استفاده شد. نتایج بخش های مختلف پروتئین بر اساس روش CNCPS در این پژوهش نشان دهنده اختلاف معنی دار بین میانگین­های نیتروژن غیرپروتئینی (بخشA)، پروتئین حقیقی محلول (بخش B1)، پروتئین با قابلیت هضم سریع در شکمبه (بخشB 2)، پروتئین با قابلیت هضم کند در شکمبه (بخشB3) و پروتئین غیرقابل تجزیه در شکمبه (بخش C) برای کنجاله بادام در مقایسه با کنجاله های سویا و تخم پنبه است (05/0>p). در روش SDS- Page دو پلی پپتید اصلی اسیدی با دامنه وزن مولکولی 63 تا 100 کیلودالتون و پلی پپتید بازی با دامنه وزن مولکولی20 تا 35 کیلودالتون برای پروتئین آماندین بادام مشاهده گردید. همچنین دو نوع پروتئین عمده در کنجاله سویا شامل گلیسینین و بتاکنگلیسینین مشاهده شد. گلیسینین دارای دو زیرواحد اسیدی (عمدتا دارای اسیدهای آمینه اسیدی) و بازی (دارای اسیدهای آمینه بازی) به ترتیب با وزن مولکولی 40 و 30/21 کیلودالتون و پروتئین بتاکنگلیسینین دارای سه زیرواحد α، ά و β با وزن مولکولی به ترتیب 83/91، 49/80 و 16/47 بود. در پژوهش حاضر، الگوی زیرواحدهای پروتئینی در کنجاله پنبه دانه نشان دهنده 4 زنجیره پلی پپتیدی بوده که مربوط به پروتئین های گلوبولین S9 با دو زیر واحد به وزن مولکولی 36/78 کیلودالتون و 10/71 کیلودالتون، گلوبولین 5S با یک زیر واحد به وزن مولکولی 47/25 کیلودالتون و آلبومین 2S با یک زیر واحد به وزن مولکولی 84/15 کیلودالتون می باشد. نتایج پژوهش حاضر نشان داد که کنجاله بادام با توجه زیر واحدها و بخش های مختلف پروتئین دارای ارزش تغذیه ای مناسب برای جایگزینی با کنجاله سویا در تغذیه دام می باشد.}, keywords_fa = {کنجاله بادام,زیرواحدهای پروتئینی,الکتروفورز SDS-Page,CNCPS}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1163.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1163_c08aca4283a22746a4ef727f13a05a5b.pdf} } @article { author = {Vosouqi, Alborz and Tohidfar, Masoud and Solouki, Mohammad and Mohsen Pour, Motahhareh}, title = {Isolation and Cloning of Two Genes from PR1 Family and Construction of Treble Plasmids Containing 3 Groups of Genes for Producing Transformed Plants Resistant to Fungal Diseases.}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {27-46}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1164}, abstract = {Fungal diseases are among the most important biotic stresses causing considerable losses in agricultural products. Improving crop plants with broad resistance to fungal diseases is one of the main challenges in agriculture. Classical plant breeding is too timely and has many other limitations, hence using biotechnology for this purpose is inevitable. Expression of a complex of Pathogen Related proteins induces polygenic resistance in plants. This technique leads to a broad and stable resistance to fungal pathogens. Hence, in this study we isolated resistance genes and constructed treble plasmid vectors with multiple genes involving three important families of disease-related proteins namely PR1, PR2, and PR3. For this purpose we isolated two genes of PR1 family with special primer design from tobacco genome, first. After analysis the accuracy of gene isolation using 35S promoter and Nos terminator, they were cloned in binary vector pBI121. Then, we cloned two important antifungal genes including PR2 (glucanase) and PR3 (chitinase) under the control of regulatory independent regions in T-DNA of the above mentioned vector with parallel and antiparallel orientations. These treble vectors have good antibacterial potential too and can be used for resistance to bacteria and other biotic and abiotic stresses. They can be introduced into plants using particle gun or through Agrobacterium mediated transformation.}, keywords = {Gene cloning,Chitinase,Glucanase,Pathogen Related proteins,PR1}, title_fa = {جداسازی و کلونکردن دو ژن از خانواده PR1 و ساخت پلاسمیدهای سهگانه حاوی سه گروه مختلف از ژنهای PR، به منظور تولید گیاهان تراریخته مقاوم به بیماریهای قارچی}, abstract_fa = {با توجه به میزان خسارت ناشی از بیماری‌های قارچی، استفاده از تکنیک‌های بیوتکنولوژی برای تولید گیاهان مقاوم، از اهمیت ویژه‌ای برخوردار است. از آنجایی که بیان ترکیبی از پروتئین‌های مربوط به بیماری‌زایی منجر به مقاومت چندژنی خواهد شد که از یک سو دوام مقاومت را به همراه داشته و از سویی دیگر باعث مقاومت به انواع گسترده‌ای از گونه‌های بیماری‌زا می‌گردد، لذا این پژوهش با هدف جداسازی ژن و ساخت سازه‌های پلاسمیدی چندگانه، حاوی سه گروه مهم از پروتئین‌های مربوط به بیماری‌زایی PR1، PR2 و PR3، انجام گردید. ابتدا دو ژن دارای ویژگی‌های متفاوت از خانواده PR1، با طراحی پرایمرهای اختصاصی، از ژنوم گیاه توتون جداسازی گردیدند و پس از آنالیزهای مربوط به صحت جداسازی ژن، طی مراحلی تحت پیشبر 35S و پایانبر Nos در پلاسمید دوگانة pBI121 کلون‌سازی شدند. در مرحله بعد، کلون‌سازی دو ژن ضدقارچی مهم دیگر، PR2 (β-1و3-گلوکاناز) و PR3 (کیتیناز)، تحت کنترل نواحی تنظیمی مستقل در ناحیة T-DNAی حامل مذکور، به دو صورت همسو و غیرهمسو به همراه PR1، طی چندین مرحله انجام شد. انتظار می رود که حاملهای سه‌گانه حاصل از این پژوهش، علاوه بر ایجاد مقاومت پایدار به طیف وسیعی از عوامل بیماری‌زای قارچی، دارای پتانسیل ایجاد مقاومت به باکتری و سایر تنش‌های زنده و غیرزنده نیز باشند. در نهایت حامل‌های مذکور را می توان برای انتقال ژن به گیاهان مختلف با روش اگروباکتریوم و تفنگ ژنی مورد استفاده قرار داد.}, keywords_fa = {پروتئینهای مربوط به بیماریزایی,کلونسازی ژن,کیتیناز,گلوکاناز,PR1}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1164.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1164_ad824de45958af917f60d6da54755001.pdf} } @article { author = {Farjami Nezhad, Reza and Asghari Zakaria, Rasoul and Zare, Nasser and Farjami Nezhad, Manouchehr}, title = {Study of karyological characteristics in several accessions of Papaver bracteatum Lindl.}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {47-58}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1165}, abstract = {Iranian poppy (Papaver bracteatum Lindl.) is one of the most important medicinal plants which its main alkaloid is thebaine. In this study karyological characteristics of five accessions of Papaver bracteatum Lindl were investigated using Aceto-Iron-Hematoxylin staining. Karyologycal characteristics including chromosomes number, chromosomes length, long and short arms length, arm ratio index, relative length of chromosomes and total length of chromosome set were measured in 10 mitotic cells. The results showed that all of the five accessions were diploid (2n=2x=14), with two pairs of metacentric and five pairs of submetacentric chromosomes. Chromosome 1 had a secondary constriction and satellite at the end of its short arm. According to the Stebbin’s assymetric categories of Karyotype, the 14299, 16986 and 23157 accessions were located in 2A class and 14305 and 14307 accessions were located in 3A class.}, keywords = {Aceto-Iron-Hematoxylin staining,Iranian Poppy,Karyotype,Papaver bracteatum Lindl}, title_fa = {مطالعه ویژگی های کاریولوژیکی در چند توده از خشخاش ایرانی ( Papaver bracteatum Lindl.)}, abstract_fa = {گیاه خشخاش ایرانی (Papaver bracteatum Lindl.) یکی از مهمترین گیاهان دارویی می­باشد که آلکالوئید اصلی آن تبائین است. در این مطالعه ویژگی­های کاریولوژیکی پنج توده خشخاش ایرانی با استفاده از روش رنگ آمیزی استو- فریک- هماتوکسیلین مورد بررسی قرار گرفت. ویژگی­های کروموزومی شامل تعداد و طول کروموزوم، طول بازوی بلند و کوتاه، طول کل مجموعه کروموزومی، شاخص نسبت بازو و طول نسبی کروموزوم­ها بر اساس میانگین 10 سلول متافازی مختلف اندازه­گیری شد. نتایج نشان داد که هر پنج توده دیپلوئید (14= x2= n2) بوده و کاریوتیپ آنها از دو جفت کروموزوم متاسانتریک و پنج جفت کروموزوم ساب‌متاسانتریک تشکیل شده است که بر روی کروموزوم شماره یک دارای ماهواره هستند. بر اساس جدول تقارن کاریوتیپی استیبنز کاریوتیپ سه توده 14299، 16986 و 23157 در گروه A2 و دو توده 14305 و 14307 در گروه A3 قرار گرفتند.  }, keywords_fa = {خشخاش ایرانی,رنگ آمیزی استو- فریک- هماتوکسیلین,کاریوتیپ,Papaver bracteatum Lindl}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1165.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1165_91f3ae16cbb0fa4a09caf9c8f0d2a392.pdf} } @article { author = {Fil koush Moqaddam, Farzaneh and Pirani, Nasrollah and Shoja, Jalil and Elyasi, Qorban and Taqi Zade, Akbar and Haji Hosseinlou, Abbas}, title = {Association of POU1F1 Gene Polymorphism and Biometric Traits in Iranian Makui Indigenous Sheep using PCR-SSCP}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {59-70}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1166}, abstract = {Inclusion of genetic marker information in animal model is an effective method for identification of superior animals with proper breeding values. Candidate genes for growth provide additional information for breeders for proper breeding programs for improvement of growth in sheep breeds. The objective of this study was to study association of POU1F1 with biometric traits in Makui sheep. For this purpose, 95 Makui sheep (males and females) were selected from Makui breeding station and subsequently extraction of DNA was done according to salting out method from whole blood. the polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the 295 bp DNA fragment (a part of intron 2, exon 3 and a part of intron 3) with a pair of designed specific primers. The single stranded conformation polymorphism (SSCP) patterns of PCR products were studied using 6% Polyacrilamid gel and silver staining method. Finally, 4 banding patterns AA, AB, CC and CD were obtained with frequencies of 0.45, 0.073, 0.44 and 0.037, respectively. The frequencies of A, B, C and D alleles were calculated as 0.48, 0.04, 0.46 and 0.02, respectively. Results indicated that studied samples was not in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). Associations of the observed polymorphisms with withers height, rump height, body length, chest girth, testis girth and leg girth were analyzed using a general linear model procedure. Significant (P<0.05) statistical relationships between polymorphism of POU1F1 gene and withers height, rump height and testis girth were found. CC genotype was associated with highest withers height and rump height (69.27 and 71.22 cm, respectively) than AB genotype (61.67 and 65.6 cm, respectively). The testis girth was highest in the CD genotype (20.55 cm) and lowest in the AB genotype (13.31 cm). Perhaps result of present study could be useful for genetic improvement of growth traits in this brees.}, keywords = {Biometric traits,Makui sheep,PCR-SSCP,polymorphism,POU1F1}, title_fa = {بررسی چندشکلی ژن POU1F1 و ارتباط آن با صفات بیومتریک در گوسفندان ماکویی به روش PCR-SSCP}, abstract_fa = {امروزه کاربرد توأم نشانگرهای ژنتیکی و اطلاعات فنوتیپی، برآورد دقیقتری از ارزشهای اصلاحی دام‌ها را فراهم نموده است. شناسایی چند شکلی‌های موجود در ژن‌های کاندیدای رشد و بررسی ارتباط آن با این صفات، اطلاعات مناسبی را برای متخصصین اصلاح نژاد مهیا می­سازد. یکی از ژن‌های کلیدی موجود ژن POU1F1 (که PIT-1 یا فاکتور 1 هورمون رشد نیز نامیده می‌شود) می‌باشد. در تحقیق حاضر پس از استخراج DNA به روش نمکی، از 95 نمونه خون گوسفندان ماکویی نر و ماده، از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 295 جفت بازی ازDNA  استفاده شد. سپس بررسی چندشکلی فرم فضایی رشته‌های منفرد (SSCP) محصولات PCR توسط ژل پلی‌آکریلامید 6% و رنگ‌آمیزی نیترات نقره انجام شد. درنهایت چهار ژنوتیپ AA، AB، CC و CD به ترتیب با فراوانی‌های 45/0، 073/0، 44/0 و 037/0 مشاهده شدند. فراوانی آللهای A، B، C و D به ترتیب 48/0، 04/0، 46/0 و 02/0 محاسبه شد. نتایج حاصل نشان دادند که تعادل هاردی- واینبرگ در جمعیت مورد مطالعه گوسفندان ماکویی وجود ندارد. ارتباط آماری بین ژنوتیپ‌ها و صفات ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از کپل، طول بدن، دور سینه، دور بیضه و دور ران در حدود سن یکسالگی توسط رویه GLM انجام گرفت. اثر ژنوتیپ برروی صفات ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از کپل و دور بیضه معنی‌دار گردید (05/0>P). دام‌های با ژنوتیپ CC دارای بیشترین میانگین ارتفاع از جدوگاه و ارتفاع از کپل (به ترتیب 27/69 و 22/71 سانتی‌متر) در مقایسه با دام‌های با ژنوتیپ AB (به ترتیب  67/61 و 6/65 سانتی‌متر) بودند. همچنین برای صفت دور بیضه ژنوتیپ‌های CD و AB به ترتیب دارای بیشترین (55/20 سانتی‌متر) و کمترین (31/13 سانتی‌متر) میانگین بودند. انتظار می­رود که این ژن بتواند بعنوان یک ژن کاندیدا برای بهبود ژنتیکی برخی صفات مربوط به رشد در این نژاد بکار رود.}, keywords_fa = {چندشکلی,صفات بیومتریک,گوسفند ماکویی,PCR-SSCP,POU1F1}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1166.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1166_105c5bb85c0c46f3ee5fe8d6be8689dc.pdf} } @article { author = {Mir Azadi, Zahra and Pile Var, Babak and Meshaktosadat, Mohammad Hadi and Karamian, Reza}, title = {Site quality and Essential oil composition of Myrtus Communis L. (case study: Cham moord site in Lorestan province)}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {71-80}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1167}, abstract = {There are many medicinal plants that could be found in fields, hill sides, and specific natural habitats. Since, medicinal plants have important roles for their uses as food sources and as disease treatments in the world, researchers attempt to identified essential oil compositions of these plants. Myrtus communis is one of the most valuable medicinal plants that widely extended in Iran. This study aimed to determine essential oil yield and composition, extracted from the Myrtus communis leaves. The leaves of Myrtus communis were collected from Cham Moord area in Lorestan province in 1389. Essential oils were extracted by hydrodistillation and essential oil components were identified by GC and GC/MS.Based on results, 21 different components in the essential oils were identified that limonene (18.5), α pinen(13.32) and cineol 1,8 (10.58) had the most essential oil yield, respectively. }, keywords = {Medicinal plants,Myrtus communis,Chemical composition,Cham moord}, title_fa = {توصیف شرایط رویشگاهی و شناسایی ترکیبات شیمیایی اسانس درختچه مورد (مطالعه موردی: رویشگاه چم مورد در استان لرستان)}, abstract_fa = {گیاهان دارویی بسیاری به صورت وحشی و طبیعی در دشت ها و دامنه کوه هاو زیست گاه های خاص خود یافت می شوند. از آنجا که این گیاهان در دنیا جهت تغذیه و درمان بیماری ها بسیار موثر و از اهمیت خاصی برخوردار می باشند، شناسایی ترکیب های موجود درآنها به خصوص گونه های بومی کشور، مورد توجه محققان و پژوهشگران این رشته قرار گرفته است. یکی از گیاهان دارویی بسیار با ارزش درختچه مورد Myrtus communis  است که در مناطق خاصی از کشور ما پراکنش دارد. هدف از بررسی حاضر تعیین درصد بازده اسانس و شناسایی ترکیبات موجود در آن است. به این منظور در سال 1389 برگ های آن از منطقه چم مورد در استان لرستان جمع آوری گردید. و به وسیله دستگاه کلونجر اسانس گیری شد. برای شناسایی ترکیبات تشکیل دهنده اسانس از دستگاه کروماتوگراف گازی(GC) و کروماتوگراف گازی متصل شده به طیف سنج جرمی (GC-MS)، با مقایسه شاخص های بازداری و مطالعه طیف های جرمی استفاده گردید. در این بررسی 21 ترکیب در اسانس این گیاه شناسایی گردید که لیمونن(5/18درصد) آلفا پینن(32/13)، سینئول 1و 8 (58/10)، به ترتیب بیشترین درصد های مواد موثره اسانس را به خود اختصاص داده بودند. تفاوت های کمی و کیفی در ترکیبات اسانس این منطقه با دیگر رویشگاه های طبیعی این درختچه میتواند ناشی از تفاوت ویژگی های اکولوژیک مناطق مانند رطوبت و ارتفاع از سطح دریا و یا سایر عوامل خاکی و جغرافیایی باشد.}, keywords_fa = {گیاهان دارویی,گیاه مورد,ترکیبات شیمیایی,چم مورد}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1167.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1167_f13ccf0811dd4043e30ef2e2079e654c.pdf} } @article { author = {Nasiri, Mohammad Reza and Parizadeh, Seyyed Amir Reza and Mahdavi, Morteza and Ariyan Nezhad, Hamid}, title = {Genetic and phylogenetic analysis of D-Loop in Persian Leopard}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {81-95}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1168}, abstract = {Persian leopard (Panthera pardus saxicolor) is the largest P. pardus subspecies in the world. But according to the sharp decline and extinction of populations in some areas, more attention to this subspecies in aspect of genetic conservation is of utmost importance. The goal of this study was to genetic and phylogenetic analysis of D-Loop region in Persian Leopard. Six biological samples of leopard bone and skin were prepared from Tandooreh National Park in Khorasan Razavi province from 2008 to 2011. After DNA extraction, 800bp fragment of the mitochondrial D-Loop was amplified with universal primers, L15926 and H16498 under polymerase chain reaction. Amplified fragments were sequenced with ABI 3130 automated machine under Sanger method. After editing the sequences, the results were compared with sequences from other studies to determine the genetic distances. Variations were not observed in the nucleotide sequences obtained in this study. Using the Neighbor-Joining phylogenetic test results showed that the Persian leopard is in group of P. pardus and its haplotype is the same with saxicolor.}, keywords = {Persian Leopard,Mitochondrial DNA,D-Loop,Phylogenetic Tree,Panthera pardus}, title_fa = {تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-Loopاز DNA میتوکندری پلنگ ایرانی}, abstract_fa = {پلنگ ایرانی(Panthera pardus saxicolor)  بزررگترین زیر گونه پلنگ در دنیا محسوب می شود. اما با توجه به کاهش شدید جمعیت و انقراض آن در برخی مناطق، توجه بیشتر به این زیر گونه خصوصا از دیدگاه ژنتیک حفاظتی دارای اهمیت زیادی می باشد. هدف از این مطالعه، بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه D-Loop ازDNA میتوکندری پلنگ ایرانی بود. برای انجام این تحقیق تعداد 6 نمونه بیولوژیک که شامل استخوان و پوست بود از پارک ملی تندوره استان خراسان رضوی طی سالهای 1387 تا 1390 جمع آوری شد. پس از استخراج DNA تکثیر قطعه 800 جفت بازی از ناحیه D-Loop میتوکندری با استفاده از واکنش زنجیره ای پلیمراز و پرایمرهای عمومی L15926 وH16498 براساس روش استاندارد انجام گردید. توالی یابی ناحیه تکثیر شده با استفاده از دستگاه خودکار ABI 3130 به روش اتوماتیک سانگر صورت گرفت و به منظور تعیین فاصله ژنتیکی با توالی های حاصل از مطالعات دیگر، مورد مقایسه قرار گرفتند. نتایج نشان داد که در بین توالی های نوکلئوتیدی نمونه های مورد مطالعه، تفاوت هاپلوتایپی وجود نداشت. همچنین نتایج آزمون فیلوژنتیکی با استفاده از روش Neighbor-Joining نشان داد که پلنگ ایرانی در گروه P. pardus قرار می گیرد و از لحاظ هاپلوتایپی مشابه زیر گونه saxicolor  می باشد.}, keywords_fa = {پلنگ ایرانی,DNA میتوکندری,D-Loop,درخت فیلوژنتیک,Panthera pardus saxicolor}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1168.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1168_64b71ab9ed53acd81753d6d69334fce1.pdf} }