@article { author = {Fil koush Moqaddam, Farzaneh and Pirani, Nasrollah and Shoja, Jalil and Elyasi, Qorban and Taqi Zade, Akbar and Haji Hosseinlou, Abbas}, title = {Association of POU1F1 Gene Polymorphism and Biometric Traits in Iranian Makui Indigenous Sheep using PCR-SSCP}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {3}, number = {2}, pages = {59-70}, year = {2012}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2012.1166}, abstract = {Inclusion of genetic marker information in animal model is an effective method for identification of superior animals with proper breeding values. Candidate genes for growth provide additional information for breeders for proper breeding programs for improvement of growth in sheep breeds. The objective of this study was to study association of POU1F1 with biometric traits in Makui sheep. For this purpose, 95 Makui sheep (males and females) were selected from Makui breeding station and subsequently extraction of DNA was done according to salting out method from whole blood. the polymerase chain reaction (PCR) was used to amplify the 295 bp DNA fragment (a part of intron 2, exon 3 and a part of intron 3) with a pair of designed specific primers. The single stranded conformation polymorphism (SSCP) patterns of PCR products were studied using 6% Polyacrilamid gel and silver staining method. Finally, 4 banding patterns AA, AB, CC and CD were obtained with frequencies of 0.45, 0.073, 0.44 and 0.037, respectively. The frequencies of A, B, C and D alleles were calculated as 0.48, 0.04, 0.46 and 0.02, respectively. Results indicated that studied samples was not in Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05). Associations of the observed polymorphisms with withers height, rump height, body length, chest girth, testis girth and leg girth were analyzed using a general linear model procedure. Significant (P<0.05) statistical relationships between polymorphism of POU1F1 gene and withers height, rump height and testis girth were found. CC genotype was associated with highest withers height and rump height (69.27 and 71.22 cm, respectively) than AB genotype (61.67 and 65.6 cm, respectively). The testis girth was highest in the CD genotype (20.55 cm) and lowest in the AB genotype (13.31 cm). Perhaps result of present study could be useful for genetic improvement of growth traits in this brees.}, keywords = {Biometric traits,Makui sheep,PCR-SSCP,polymorphism,POU1F1}, title_fa = {بررسی چندشکلی ژن POU1F1 و ارتباط آن با صفات بیومتریک در گوسفندان ماکویی به روش PCR-SSCP}, abstract_fa = {امروزه کاربرد توأم نشانگرهای ژنتیکی و اطلاعات فنوتیپی، برآورد دقیقتری از ارزشهای اصلاحی دام‌ها را فراهم نموده است. شناسایی چند شکلی‌های موجود در ژن‌های کاندیدای رشد و بررسی ارتباط آن با این صفات، اطلاعات مناسبی را برای متخصصین اصلاح نژاد مهیا می­سازد. یکی از ژن‌های کلیدی موجود ژن POU1F1 (که PIT-1 یا فاکتور 1 هورمون رشد نیز نامیده می‌شود) می‌باشد. در تحقیق حاضر پس از استخراج DNA به روش نمکی، از 95 نمونه خون گوسفندان ماکویی نر و ماده، از واکنش زنجیره‌ای پلیمراز برای تکثیر قطعه 295 جفت بازی ازDNA  استفاده شد. سپس بررسی چندشکلی فرم فضایی رشته‌های منفرد (SSCP) محصولات PCR توسط ژل پلی‌آکریلامید 6% و رنگ‌آمیزی نیترات نقره انجام شد. درنهایت چهار ژنوتیپ AA، AB، CC و CD به ترتیب با فراوانی‌های 45/0، 073/0، 44/0 و 037/0 مشاهده شدند. فراوانی آللهای A، B، C و D به ترتیب 48/0، 04/0، 46/0 و 02/0 محاسبه شد. نتایج حاصل نشان دادند که تعادل هاردی- واینبرگ در جمعیت مورد مطالعه گوسفندان ماکویی وجود ندارد. ارتباط آماری بین ژنوتیپ‌ها و صفات ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از کپل، طول بدن، دور سینه، دور بیضه و دور ران در حدود سن یکسالگی توسط رویه GLM انجام گرفت. اثر ژنوتیپ برروی صفات ارتفاع از جدوگاه، ارتفاع از کپل و دور بیضه معنی‌دار گردید (05/0>P). دام‌های با ژنوتیپ CC دارای بیشترین میانگین ارتفاع از جدوگاه و ارتفاع از کپل (به ترتیب 27/69 و 22/71 سانتی‌متر) در مقایسه با دام‌های با ژنوتیپ AB (به ترتیب  67/61 و 6/65 سانتی‌متر) بودند. همچنین برای صفت دور بیضه ژنوتیپ‌های CD و AB به ترتیب دارای بیشترین (55/20 سانتی‌متر) و کمترین (31/13 سانتی‌متر) میانگین بودند. انتظار می­رود که این ژن بتواند بعنوان یک ژن کاندیدا برای بهبود ژنتیکی برخی صفات مربوط به رشد در این نژاد بکار رود.}, keywords_fa = {چندشکلی,صفات بیومتریک,گوسفند ماکویی,PCR-SSCP,POU1F1}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_1166.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_1166_105c5bb85c0c46f3ee5fe8d6be8689dc.pdf} }