@article { author = {Poursiahbidi, Mohammad Mehdi and Cheghamirza, Kianoosh and Bahraminejad, Sohbat and Arzani, Ahmad and Ashraf mehrabi, Ali}, title = {Evaluation of genetic variation in einkorn wheat originated from west Iran using microsatellite markers}, journal = {Agricultural Biotechnology Journal}, volume = {12}, number = {2}, pages = {183-208}, year = {2020}, publisher = {Shahid Bahonar University of Kerman and Iranian Biotechnology Society}, issn = {2228-6705}, eissn = {2228-6500}, doi = {10.22103/jab.2020.15516.1212}, abstract = {Objective Genetic diversity in field crops and their wild ancestors plays important role in breeding programs. The aim of this study was to investigate the genetic diversity of einkorn (Triticum monococcum L. ssp. boeoticum) wheat genotypes collected from western parts of Iran using SSR markers.   Material and methods In this study, genetic variation of 163 genotypes from 34 populations of einkorn wheat collected from western parts of Iran was investigated using 19 SSR loci developed in the A genome of hexaploid wheat.   Results In the investigation of 163 einkorn genotypes using 19 microsatellite loci were generated 151 polymorphic alleles with an average of 7.94 per locus. The content of polymorphic information content (PIC) in the studied einkorn genotypes ranged from 0.64 for Xgwm480-3A locus to 0.89 for Xgwm4-4A locus. The mean content of polymorphic information in the studied genotypes was 0.77. According to the results, Xgwm4-4A, Xgwm610-4A and Xgwm282-7A loci were identified as the most suitable primers for studying genetic diversity and differentiation of einkorn wheat genotypes. The mean of Shannon coefficient of 0.16 indicated moderate variation in genotypes under study. The average percentage of polymorphic gene loci in the 34 studied populations was 36.74 and the average heterozygosity was 0.114. Based on analysis of molecular variance for 34 populations, the variations between and within populations were calculated as 7% and 93%, respectively. Cluster analysis based on Jaccard coefficients and UPGMA algorithm classified the einkorn genotypes into 10 distinct groups. The results of the principal coordinate analysis revealed that the two primary vectors explained 29.33% and 24.01% of the total molecular genetic variance, respectively.   Conclusion The results indicated the usefulness of microsatellite markers in identifying and grouping einkorn wheat genotypes, so that the obtained information could be used in breeding projects, germplasm conservation planning and collection of einkorn wheat populations.}, keywords = {Einkorn wheat,microsatellite markers,Triticum monococcum L. ssp. boeticum,West of Iran}, title_fa = {ارزیابی تنوع ژنتیکی گندم‌‌های اینکورن غرب ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره‌ای}, abstract_fa = {هدف: وجود تنوع ژنتیکی در گیاهان زراعی و اجداد وحشی آن‌ها نقش مهمی در پیشرفت برنامه‌های به‌نژادی دارد. گونه‌ اینکورن (Triticum monococcum L. ssp. boeoticum) در نواحی غربی ایران تنوع وسیع و پراکنش جغرافیایی گسترده‌ای دارد. هدف از این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی گندم‌های اینکورن جمع‌‌آوری شده از این منطقه با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره‌‌ای بود. مواد و روش‌ها:تنوع ژنتیکی 163 ژنوتیپ گندم‌ اینکورن جمع‌آوری شده از 34 مکان متفاوت از سه استان غربی ایران با استفاده از 19 جایگاه ژنی SSR از ژنوم A گندم هگزاپلویید بررسی شد. نتایج: در 163 ژنوتیپ گندم اینکورن مورد مطالعه در مجموع 151 آلل چندشکل برای 19 جایگاه ریزماهواره‌ای با میانگین 94/7 شناسایی شد. دامنه محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC)  در ژنوتیپ‌‌های مورد مطالعه بین 64/0 برای جایگاه ژنی Xgwm480-3A تا 89/0 برای جایگاه ژنی Xgwm4-4A متغیر بود. میانگین محتوای اطلاعات چندشکلی در ژنوتیپ‌های مورد مطالعه 77/0 بود. با توجه به نتایج بدست آمده جایگاه‌های ژنیXgwm4-4A ، Xgwm610-4A و Xgwm282-7A مناسب‌ترین جایگاه‌ها برای بررسی تنوع ژنتیکی و تمایز ژنوتیپ‌های مورد مطالعه گندم اینکورن تشخیص داده شدند. میانگین ضریب شانون به میزان 16/0 نشان دهنده تنوع متوسط در ژنوتیپ‌های تحت بررسی بود. متوسط مکان‌های ژنی چندشکلی در 34 جمعیت مورد مطالعه 74/36 درصد و میانگین هتروزیگوسیتی برابر 114/0 برآورد شد. بر اساس نتایج تجزیه واریانس مولکولی برای 34 جمعیت گندم اینکورن، اختلاف بین و درون جمعیت‌های مورد مطالعه به ترتیب 7 و 93 درصد مشاهده شد. تجزیه خوشه‌ای با استفاده از ضرایب جاکارد و بر اساس الگوریتم UPGMA ژنوتیپ‌های­ مورد مطالعه گندم اینکورن را در 10 گروه طبقه‌بندی نمود. طبق نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی دو بردار اولیه به ترتیب 33/29 و 01/24 درصد از کل واریانس ژنتیکی مولکولی را تبیین نمودند.  نتیجه‌گیری: نتایج حکایت از مفید بودن نشانگرهای ریزماهواره در شناسایی و گروه‌بندی ژنوتیپ‌های گندم اینکورن داشت، به‌طوریکه از اطلاعات بدست آمده می‌توان در پروژه‌های اصلاحی، برنامه‌ریزی حفاظت ژرم پلاسم و ایجاد کلکسیون از جمعیت‌های گندم اینکورن استفاده نمود.}, keywords_fa = {غرب ایران,گندم اینکورن,نشانگرهای SSR,Triticum monococcum L. ssp. boeoticum}, url = {https://jab.uk.ac.ir/article_2678.html}, eprint = {https://jab.uk.ac.ir/article_2678_2d18233d76ba4fb9730a8b745de8a25c.pdf} }