%0 Journal Article %T مقایسه روش های مختلف لایه بندی جمعیتی گاوهای سرابی و نجدی با استفاده از نشانگرهای ژنتیکی متراکم %J مجله بیوتکنولوژی کشاورزی %I دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران %Z 2228-6705 %A خصالی اقطاعی, احد %A وفای واله, مهدی %A داشاب, غلامرضا %A مرادی شهربابک, حسین %D 2019 %\ 05/22/2019 %V 11 %N 1 %P 25-54 %! مقایسه روش های مختلف لایه بندی جمعیتی گاوهای سرابی و نجدی با استفاده از نشانگرهای ژنتیکی متراکم %K چندشکلی های تک نوکلئوتیدی %K خوشه بندی شبکه ای بدون نظارت %K داده کاوی %K ساختارجمعیتی %R 10.22103/jab.2019.13193.1098 %X هدف: تاکنون از روش­های مختلفی برای بررسی ساختار جمعیتی با استفاده از نشانگرهای موجود درکل ژنوم (چند شکلی­های تک­نوکلئوتیدی (SNP)) استفاده شده است که هر کدام نقاط ضعف و قوتی دارند. در پژوهش حاضر از خوشه­بندی شبکه­ای بدون نظارت یا SPC که روشی مبتنی بر داده­کاوی است، برای بررسی ساختار جمعیت گاوهای سرابی و نجدی استفاده شد. مواد و روش­ها: جمعیت مورد مطالعه 424 رأس گاو شامل 213 رأس گاو نجدی و 211 رأس گاو سرابی بود که باChip 40 K v 2 Illumina Bead برای نشانگرهای تک­نوکلئوتیدی تعیین توالی شدند. برای تجزیه ساختار جمعیت از بسته­ی نرم­افزاری (SPIN) SORTING POINTS INTO NEIGHBORHOOD  استفاده شد. بعد از ویرایش داده­ها، 27859 نشانگر اتوزومی تجزیه و تحلیل شدند. نتایج: خوشه­بندی بر اساس شباهت­ها و تفاوت­های نوکلئوتیدها، منجر به طبقه­بندی دو جمعیت پایه و نه زیر جمعیت شد. نتیجه­گیری: در مقایسه با سایر روش­های موجود برای لایه­بندی جمعیت، در حال حاضر روش SPIN با توجه به عدم نیاز به فرض­های پیشین، کارایی مناسبی جهت تجزیه و تحلیل ساختار جوامع دارد. %U https://jab.uk.ac.ir/article_2348_576170ff533d489fd6f812a4a3cb28c1.pdf