2024-03-29T19:23:01Z
https://jab.uk.ac.ir/?_action=export&rf=summon&issue=189
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
بررسی کروموزومهای شماره 1 و 5 بز مرخز برای مکانیابی QTLهای موثر بر وزن بدن
نجات
باد برین
سید ضیاءالدین
میر حسینی
بابک
ربیعی
نوید
قوی حسین زاده
وزن بدن یکی از صفات مهم در پرورش دامها است که دارای توارث کمّی است. نقشهیابی QTL علاوه بر اطلاعات بسیار مفیدی که در زمینه نواحی ژنومی کنترل کننده صفات کمی فراهم میکند، میتواند اصلاحگران را در انتخاب به کمک نشانگر کمک نماید. با توجه به تحقیقات پیشین و همپوشانی نسبی نقشه ژنتیکی گوسفند و بز، مطالعه حاضر با هدف شناسایی QTLهای موثر بر وزن بدن روی کروموزومهای 1 و 5 بز مرخز با استفاده از 11 نشانگر ریزماهواره صورت گرفت. جمعیت مورد مطالعه شامل 248 دام متعلق به 8 خانواده ناتنی پدری بود که برای 11 جایگاه ریزماهواره مربوط به کروموزومهای 1و 5 تعیین ژنوتیپ شدند. دادههای فنوتیپی شامل صفات اوزان تولد، 4 ماهگی، 6 ماهگی، 9 ماهگی و 12 ماهگی بودند که برای اثرات ثابت سال تولد، جنس و نوع تولد تصحیح شدند. آنالیز QTL به روش مکانیابی درون فاصلهای مبتنی بر رگرسیون انجام گرفت. در این پژوهش روی کروموزوم 1 در سطح آماری مورد نظر، QTL معنیداری یافت نشد. در حالیکه روی کروموزوم 5 یک ناحیه ژنومی با اثر معنیدار (P<0.05) روی صفات وزن بدن در 4 ماهگی و 6 ماهگی در فاصله 2 تا 8 سانتی مورگان از نشانگر OarFCB005 یافت شد، لذا به نظر میرسد این مکان حاوی ژنهای موثر بر اوزان بدن پس از تولد باشد. با توجه به اینکه مکان QTL تعیین شده در نزدیکی نشانگر OarFCB005 قرار داشت، بنابراین در صورت تایید آن توسط تحقیقات بیشتر، از این نشانگر میتوان در انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.
بز مرخز
نشانگرهای ریزماهواره
وزن بدن
QTL
2015
08
23
1
10
https://jab.uk.ac.ir/article_1141_b149ecb11bb385fed388c46b6868810f.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
کاربرد بیومارکرهای لیپیدی برای ارزیابی ساختار جمعیت میکروبی خاک
محسن
برین
ناصر علی
اصغر زاد
میر حسن
رسولی صادقیانی
تعادل اکولوژیک جوامع میکروبی خاک، با توجه به نقش حیاتی و محوری آنها به عنوان شاخص سلامت اکوسیستم خاک، از اهمیت بالایی برخوردار میباشد. بهرهگیری از روشهای مختلف برای دستیابی به وضعیت جامعه میکروبی خاک وجود دارد. روشهای کشت میکروبی برای این منظور مناسب نیستند، زیرا قسمت اعظم ریزجانداران قادر به رشد در محیط کشت نمیباشند. روشهای مولکولی و تکنیکهای بر پایه DNA فقط تنوع میکروبی را میدهند. پس یک روش سریع برای ارزیابی ساختار جامعه میکروبی در خاک استفاده از الگو اسید چرب فسفولیپیدی (PLFA) میباشد (زیرا بعد از مرگ سلول به سرعت توسط فعالیت آنزیم فسفاتاز تجزیه میشود). بهعلاوه PLFA میتواند اطلاعات وسیع از تنوع، زیستتوده و وضعیت تغذیهای– فیزیولوژیک آنها فراهم آورد. PLFAهای مخصوص و معینی مثل نسبت اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (ترانس) 16:1ω7t به اسید چرب فسفولیپید با موقعیت (سیس) 16:1ω7c (trance/cis)، نسبت مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی سیکلوپروپیل (cy17:0 و cy19:0) به مجموع اسیدهای چرب فسفولیپیدی با یک پیوند دوگانه پیشگام 16:1ω7و 18:1ω7) (cy/pre)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی اشباعشده به غیراشباع با یک پیوند دوگانه (S/M)، نسبت اسیدهای چرب فسفولیپیدی باکتریهای گرم منفی به اسیدهای چرب باکتریهای گرم مثبت (G-/G+) و نسبت اسید چرب فسفولیپیدی قارچهای ساپروفیت (18:2ω6,9) به اسیدهای چرب نشانگر باکتریها (F/B)، قادرند به عنوان شاخصهای وضعیت فیزیولوژیکی یا تغذیه در شرایط مختلف محیطی همچون خاکهای آلودهشده به فلزات سنگین، تغییرات pH، تغییرات عمق، خشکی، شوری، مدیریتهای مختلف کشاورزی و شرایط غرقابی، برای ارزیابی جوامع میکروبی خاک به کار میروند. روش تجزیه PLFA در خاک و تعیین زیستتوده، تنوع میکروبی و وضعیت فیزیولوژیک در اینجا بررسی میشود
اسیدهای چرب فسفولیپید
تنش های محیطی
ارزیابی محیط
اسیدهای چرب نشانگر
ساختار جوامع میکروبی
2015
08
23
11
36
https://jab.uk.ac.ir/article_1360_2c6eb4d1587180f949c1e54ac28089d1.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
جداسازی و همسانهسازی ژن منگنزپراکسیداز (mnp) از قارچ صدفی خوراکی
مژگان
پروندی
محمد
فارسی
امین
میرشمسی
محسن
اشرفی
در قارچ صدفی خوراکی (Pleurotus ostreatus) آنزیمهای مختلفی از ابتدای رشد میسلیومی تا انتهای دورهی میوهدهی، تجزیه ترکیبات لیگنینی را در محیط کشت بر عهده دارند. چوب، بقایای گیاهی و بیشتر ضایعات گیاهی دیگر در طبیعت تحت عنوان ترکیبات لیگنوسلولزی نامیده میشوند. لیگنوسلولز عمدتاً از سلولز، همیسلولز و لیگنین تشکیل میشود. آنزیم منگنزپراکسیداز (EC:1:11:1:13)، یکی از عمومیترین پراکسیدازهای تخریبکننده لیگنین است که توسط اکثر قارچهای تجزیهکننده چوب و نیز بسیاری از قارچهای تجزیهکننده کمپوست تولید میشود. در این پژوهش بهمنظور جداسازی cDNAی ژن mnp قارچ صدفی خوراکی (P. ostreatus var. florida)، استخراج RNAو سپس سنتز cDNA انجام و بر اساس توالی ژن mnp و با استفاده از نرمافزار Primer Premier (V. 5.0) آغازگرها طراحی گردید و با واکنش زنجیرهای پلیمراز تکثیر شد. قطعه تکثیر شده در ناقل PTG19-T وارد شد و با استفاده از توالییابی تأیید شد. در ادامه، ژن mnp در ناقل p13H88 همسانهسازی گردید. سپس با روش یخ-ذوب به Ecoli (سویهیDH5α ) منتقل و تأیید حضور آن در باکتری با روش هضم آنزیمی انجام گرفت. نتایج نشان داد که ژن mnp در ناقل p13H88 همسانهسازی شده است. پلاسمید نوترکیب بدست آمده با نام p13H88-FM نامگذاری شد.
تجزیه لیگنین
ناقل
لیگنوسلولز
منگنزپراکسیداز
2015
08
23
37
54
https://jab.uk.ac.ir/article_1361_821879d5dfe311b6717158e63d42420b.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
جایگزینی سیستئین 11 با سرین در یکی از ایزوفرمهای تیوردوکسین برنج (OsTrx23) با روش جهشزایی هدایت شده و اثر آن بر میزان دایمر شدن و فعالیت احیایی
میترا
رودگر نشتا
آذر
شاه پیری
تیوردوکسین (Trx) ها، پروتئینهایی کوچک هستند که با داشتن یک گروه تیول- دیسولفید در جایگاه فعالشان نقش مهمی در تنظیم اکسایش- احیای سلولی دارند. برخلاف جانوران و پروکاریوتها، در گیاهان ایزوفرم های مختلفی Trx وجود دارد که بر اساس مجل آنها در سلول در هشت زیرگروه f، m، x، y، z، o، s و h قرار میگیرند. ایزوفرمهای مختلفی از Trx h در سیتوپلاسم سلول های گیاهی وجود دارند. از جمله در برنج نه ایزوفرم Trx h وجود دارد که از این میان ایزوفرمهای OsTrx20، OsTrx1، OsTrx23 و OsTrx18 علاوه بر دو اسیدآمینهیCys در جایگاه فعال، دارای یک یا دو Cys اضافی در انتهای آمین توالی خود نیز میباشند. در پژوهش حاضر به منظور بررسی نقش Cys انتهای در توالی پروتئین OsTrx23، با روش جهشزایی هدایتشده Cys11باُSer جایگزین شد. پروتئین جهشیافته (C11SOsTrx23) و طبیعی (WtOsTrx23) در باکتری اشریشیاکلی سویه روزتا به صورت دگرساخت بیان و خالصسازی شدند و فعالیت احیایی آنزیمهای طبیعی و جهشیافته در واکنش با انسولین بررسی شد. همچنین دایمر و مونومر بودن این پروتئین ها از طریق ران کردن آنها در دو شرایط احیاء و عدم احیاء بر روی ژل SDS-PAGE مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس نتایج به دست آمده سیستئین انتهایی درOsTrx23، با ایجاد پیوند دیسولفیدی نقش کلیدی در دایمرشدن پروتئین دارد اما تأثیری بر فعالیت احیایی ندارد.
تیوردوکسین
جهش زایی هدایتشده
سیستئین
دایمرشدن
2015
08
23
55
66
https://jab.uk.ac.ir/article_1362_e314e471d61bf2005aedf35576fcfcab.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
تجزیه ژنتیکی-مولکولی ابعاد دانه برنج در جمعیت لاینهای نوترکیب تلاقی عنبربو × سپیدرود با استفاده از نشانگرهای SSR و AFLP
حسین
صبوری
احمد رضا
دادرس
عاطفه
صبوری
مهناز
کاتوزی
در ایران کیفیت برنج عموماً اهمیت بیشتری نسبت به عملکرد دارد، بنابراین اصلاح ارقام برنج از لحاظ کیفیت جایگاه مهمی را دارا میباشد. در پژوهش حاضر به منظور بررسی ساختار ژنتیکی و مکانیابی ژنهای کنترل کننده خصوصیات ظاهری دانه برنج، از 96 لاین اینبرد نوترکیب (نسل هشتم) حاصل از تلاقی ارقام عنبربو × سپیدرود استفاده شد. برای تشکیل نقشه پیوستگی ابتدا تعداد 365 نشانگر ریزماهواره و 35 ترکیب آغازگری AFLP در والدین مورد ارزیابی قرار گرفتند. سپس از 124 نشانگر ریزماهواره و 21 ترکیب آغازگری AFLP که 263 نوار چندشکل و واضح تولید کرده بودند برای تعیین ژنوتیپ کل افراد جمعیت استفاده شد. نقشه ژنتیکی حاصل با تعداد کل 387 نشانگر، 4/1950 سانتیمورگان از ژنوم برنج را پوشش دادند. مکانیابی فاصلهای مرکب بر روی صفات کیفی ظاهری برنج، تعداد 13 QTL برای هشت صفت شناسایی نمود. از این تعداد هشت QTL، بیش از 15 درصد از تغییرات صفات موردنظر را توجیه نمودند. برای وزن تک دانه پخته شده، دو QTL، طول و عرض برنج سفید، بترتیب سه و یک QTL، شکل دانه خام و پخته شده به ترتیب دو و سه QTL و برای طول و عرض برنج پخته شده بترتیب سه و یک QTL شناسایی شد. با توجه به پایدار بودن جمعیت مکانیابی مورد استفاده، انتظار میرود بتوان با اطمینان بیشتری از QTLهای شناسایی شده در برنامههای انتخاب به کمک نشانگر و مکانیابی دقیق استفاده نمود.
برنج
ریزماهواره
کیفیت
مکانیابی
AFLP
2015
08
23
67
86
https://jab.uk.ac.ir/article_1363_6110d43768e0dc7ca6672aa2d8d6bc37.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
بررسی EST های گندم در برهمکنش با قارچ بیمارگر Mycosphaerella graminicola
جلال
غلام نژاد
فروغ
سنجریان
ابراهیم
محمدی گل تپه
ناصر
صفایی
خدیجه
رضوی
در این مطالعه، 10438 EST که در پایگاه NCBI در رابطه با تعامل گندم و بیمارگر Mycosphaerella graminicola (فرم غیرجنسی Zymoseptoria tritici) ثبت شده بودند، استخراج شدند. پروتئینهای غیر تکراری و مرتبط با EST ها در بانک اطلاعاتی NCBI توسط نرم افزار SEQtoolsبه دست آمدند. این پروتئین ها بر اساس نوع، طبقه بندی شده و در 279 گروه قرار گرفتند. سپس در سایتKEGG ، مسیر 112 عدد از این پروتئینها تجزیه و تحلیل و 55 مسیر شناسایی و ارتباط بین این مسیرها و پاسخهای دفاعی گندم مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه این مسیرها بر اساس عملکرد گروهبندی شده و در هشت گروه عملکردی (شامل پروتئینهای دفاعی، پروتئینهای درگیر در فرایند انرژی سلولی، پروتئینهای درگیر در فرایند متابولیسم سلولی، پروتئینهای درگیر در فرایند پردازش پروتئینها، پروتئینهای درگیر در فرایند پردازش RNA، پروتئینهای درگیر در چرخههای سلولی، پروتئینهای درگیر در تخریب پروتئینها و پروتئینهای درگیر در فرایند سیگنالدهی سلولی) قرار گرفتند. مسیرهای متابولیکی تثبیت کربن در فرایند فتوسنتز و پروتئینهای درگیر در فرایند دفاعی به ترتیب با دارا بودن 745 و 251 EST، در مرتبۀ اول و دوم قرار داشتند.. سپس نقش ESTها مخصوصاً آنهایی که در مسیرهای دفاعی گیاهی درگیر بودند به صورت موردی مطالعه شدند و عملکرد آنها در مسیر دفاع گیاه گندم مشخص شد. با استفاده از اطلاعاتی که این بررسی در اختیار قرار میدهد میتوان ژنهای دیگری که به طور مستقیم و همچنین غیر مستقیم در فعالیتهای دفاعی گیاهی شرکت میکنند، مورد بررسی قرار داد.
گندم
KEGG
NCBI
SEQtools
EST
Mycosphaerella graminicola
2015
08
23
87
106
https://jab.uk.ac.ir/article_1364_a1e9ae078d95610386e304cead6d73e1.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
تراریختی گیاه کلزا با ساختار ترکیبی حاوی ژن جهش یافته epsps و ترادف نشانه کلروپلاستی به منظورافزایش تحمل به علف کش گلیفوسیت
مه لقا
قوامی
امیر
موسوی
علی هاتف
سلمانیان
فرانک
هادی
گیاهان زراعی متحمل نسبت به علف کش گلیفوسیت یکی از کاراترین روش های موجود در کنترل علف های هرز مزارع محسوب می شود. گلیفوسیت با مهار آنزیم EPSPS (5-انول پیرویل شیکیمات-3-فسفات سنتاز) در مسیر شیکیمات مانع سنتز اسید های آمینه حلقوی و در نتیجه مرگ گیاه می شود. یکی از موثرترین راه های ایجاد گیاهان مقاوم به علف کش گلیفوسیت، دست ورزی ژن کد کننده آنزیم EPSPS به منظور کاهش تمایل گلیفوسیت به این آنزیم می باشد. در مطالعات گذشته از روش جهش زایی هدایت یافته برای ایجاد دو جهش نقطه ای در ژن epsps اشرشیا کولی جهت تبدیل اسید آمینه گلیسین 96 به آلانین و آلانین 183 به ترئونین استفاده شد. در این تحقیق، ژن epsps باکتری اشرشیاکولی(Ec-epsps) با دو جهش مذکور، به پپتید نشانه کلروپلاستی ژن epsps مربوط به گیاه کلزا متصل شد. سپس، سازه ژنی حاصله در ناقل بیانی گیاهی pBI121 همسانه سازی و با روش مبتنی بر Agrobacterium به گیاه کلزا رقم PF-704591منتقل شد. حضور و بیان ژن مورد نظر با آنالیز های مولکولی بررسی و نتایج حاصل از آزمون زیستی نشان داد که گیاهان تراریخت، علف کش گلیفوسیت را تا سطح 2 میلی مولار تحمل می نمایند. در حالی که گیاهان شاهد در غلظت 5/0 میلی مولار از علف کش از بین رفتند.
کلزا Brassica napus L. ))، مقاومت به علف کش
گلیفوسیت،epsps دستورزی شده، پپتید نشانه کلروپلاستی
2015
08
23
107
120
https://jab.uk.ac.ir/article_1366_44d148f9eff18bf981d6af3da76afeab.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
تولید آنتوسیانین در کشت کالوس سیب: اثر منبع نیتروژن و غلظت منیزیم
فرشاد
کاکاوند
ناصر
مهنا
آنتوسیانینها بدلیل توانایی آنها در محافظت انسان در برابر بیماریهای مزمن، توجه زیادی را به خود معطوف ساختهاند. تولید آنتوسیانینهای طبیعی از مواد گیاهی تازه با محدودیتهای متعددی مواجه است. بنابراین، استفاده از بیوتکنولوژی گیاهی جهت تولید آنتوسیانین بدون محدودیتهای ذکر شده مورد توجه قرار گرفته است. از طرف دیگر، برخی از سیبهای زینتی میتوانند آنتوسیانین را در اندامهای مختلف خود از جمله بافت کالوس درون شیشهای تولید کنند. در این تحقیق، به منظور بررسی اثر غلظتهای مختلف منیزیم و منبع نیتروژن محیط کشت بر روی تولید درونشیشهای آنتوسیانین ازکالوس یک ژنوتیپ سیب زینتی گوشت قرمز، ابتدا از ریزنمونههای برگ گیاهچههای درون شیشهای جهت تولید کالوس استفاده گردیده و پس از بدست آوردن کالوس به مقدار مورد نیاز، تیمارهای مورد نظر در قالب طرح کاملا تصادفی با چهار تکرار و چهار نمونه در هر تکرار اعمال گردید. افزودن منیزیم به محیط کشت میزان تولید آنتوسیانین را تا سه برابر افزایش داد و بیشترین میزان آنتوسیانین در بالاترین غلظت منیزیم (40 میلیمولار) مشاهده گردید. البته در این غلظت میزان رشد کالوسها کاهش یافت. تغییر منبع نیتروژن نیز بر تولید آنتوسیانین اثر گذاشت و بهترین منبع نیتروژن برای تولید آنتوسیانین، ترکیب آمونیوم 10 میلیمولار بعلاوه نیترات 8/18 میلیمولار و آمونیوم 5 میلیمولار بعلاوه نیترات 25 میلیمولار بود.
آمونیوم
آنتوسیانین
کالوس
منیزیم
نیترات
2015
08
23
121
134
https://jab.uk.ac.ir/article_1368_b4066a2a2031e266d3133784912374a8.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
کاربرد نشانگرهای ریزماهواره جهت شناسایی و ثبت ارقام پسته
محسن
مردی
مهرشاد
زین العابدینی
علی
تاج آبادی پور
با توجه به اینکه شناسایی ارقام پسته (Pistachia Vera L.) با استفاده از خصوصیات مورفولوژیک در مرحله نونهالی دشوار است، ابزارهای مولکولی نوین چشم انداز جدیدی را در زمینه انگشت نگاری DNA فراهم کرده اند. در این تحقیق با استفاده از 25 نشانگر SSR و 12 جفت آغازگر اختصاصی نشانگر AFLP، کلید شناسایی مولکولی 10 رقم پسته ایرانی (Pistacia vera) حاصل گردید. نتایج این تحقیق نشان داد، علیرغم استفاده از 25 نشانگر مولکولی SSR، تنها چهار نشانگر چند شکل بوده و نتایج آنها منجر به شناسایی کلیدهای مولکولی اختصاصی برای 10 رقم پسته مورد مطالعه نشد. 12 ترکیب نشانگر AFLP در 10 رقم پسته ایرانی کلیدهای اختصاصی مولکولی ایجاد کردند. از مجموع 12 جفت آغازگر AFLP استفادهشده، دو جفت آغازگر M_TTT-E_GTC و M_GAG-E_CAG برای 8 رقم مورد مطالعه پسته کلید مولکولی، ایجاد نمودند. جفت آغازگر M_TTT-E_GTC در ارقام عباس علی- احمد آقایی- بادامی سفید- فندقی 48- ممتاز- اوحدی و شاهپسند و جفت آغازگر M_GAG-E_CAG در رقم اکبری کلیدهای مولکولی اختصاصی ایجاد نمودند. نتایج این تحقیق نشان داد که زمینه ژنتیکی مشابهی بین درختان مادری ارقام ایرانی پسته وجود دارد. کلیدهای مولکولی اختصاصی بهوسیله تجزیههای مولکولی بر روی 36 درخت مادری ایجاد و نتایج این تحقیق در دو آزمایشگاه مستقل تأیید شد. کلیدهای مولکولی اختصاصی گزارش شده می توانند در شناسایی 10 رقم پسته ایرانی مورد استفاده قرار گیرند.
پسته
ریزماهواره
انگشتنگاری
روشهای مبتنی بر مدل
تجزیه خوشهای
2015
08
23
135
154
https://jab.uk.ac.ir/article_1369_3c381d4ea83c53a1e5cb537a2b5b3e44.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
جداسازی، بیان ژن و تولید پروتئین افکتور PthA باکتری Xanthomonas citri subsp citri عامل بیماری شانکر مرکبات
مریم
مختاری
محمدرضا
صفرنژاد
سید مهدی
علوی
آدم
ترکمن زهی
بیماری شانکر باکتریایی مرکبات از جمله مهمترین بیماری های باغات لیموی مکزیکی در جنوب کشور می باشد که توسط باکتری Xanthomonas citri subsp. citri (Xcc) ایجاد میشود. پروتئین PthA باکتری عامل شانکر مرکبات، به عنوان پروتئین افکتور، نقش اساسی در فرایند بیماری زایی دارد و لذا غیر فعال سازی آن با استفاده از آنتی بادی می تواند منجر به ایجاد مقاومت بر علیه بیماری شود. در این تحقیق جداسازی و بیان ژن pthA و خالصسازی پروتئین حاصل از آن صورت پذیرفته است. برای این منظور با استفاده از منابع اطلاعاتی بانک ژن، آغازگرهای اختصاصی برای جداسازی ژن pthA طراحی شد و سپس قطعه ژنی مربوطه در ناقلpTZ57R/T همسانه سازی گردید. ژن مزبور سپس به صورت متصل به دنباله شش تایی هیستیدین در ناقل بیانی باکتریایی pET28a همسانه سازی گردیده و بیان آن به صورت نوترکیب در سویه BL21(DE3) باکتری Escherichia coli صورت پذیرفت. خالصسازی پروتئین نوترکیب PthA در شرایط طبیعی غیر واسرشتی و با استفاده از روش کروماتوگرافی تمایلی بر روی ستون نیکل صورت پذیرفت. صحت بیان پروتئین مذکور با روش های الکتروفورز پروتئین و وسترن بلاتینگ با استفاده از آنتی بادی های اختصاصی توالی شش تایی هیستیدین مورد بررسی و تایید قرار گرفت. پروتئین نوترکیب خالص بدست آمده می تواند به عنوان آنتی ژن برای تولید آنتی بادی های نوترکیب مونوکلونال مورد استفاده قرار گیرد.
شانکر مرکبات
پروتئین نوترکیب
افکتور پروتئین PthA
Xanthomonas citri subsp.citri
2015
08
23
155
170
https://jab.uk.ac.ir/article_1370_1ac448a5057899ee792b46436f18d1ec.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
اثر فشار اسمزی بر ریزغده زایی درون شیشه ای در سیب زمینی رقم آگریا با کاربرد غلظت های مختلف ساکارز و پلی اتیلن گلایکول
علیرضا
مطلبی آذر
سمانه
کاظمیانی نجف آبادی
نسرین
اکبری
اثر پنج غلظت ساکارز و پلی اتیلن گلایکول هر کدام (0/0، 05/0، 11/0، 17/0 و 23/0 مول بر لیتر) بر آغازش، تشکیل و رشد ریزغده بررسی شد. گره های حاصل از شاخساره های درون شیشه ای در محیط کشتMS کشت شدند و در تاریکی مداوم و دمای 1±20 درجه سانتیگراد نگهداری شدند. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که اختلاف معنی داری بین تیمارهای اعمال شده از نظرآغازش و تشکیل ریزغده، همچنین طول، قطر و وزن تر ریز غده ها وجود داشت و ساکارز در فرآیند ریزغده زایی (در کلیه صفات) برتر از پلی اتیلن گلایکول و استفاده از سطوح بالای ساکارز در تشکیل ریزغده در شرایط درون شیشه ای مفید بود. افزایش ساکارز، تعداد ریزغده را بدون اثر منفی روی وزن و اندازه آنها به طور موثری افزایش داد. پلی اتیلن گلایکول بکار برده شده در محیط کشت، منجر به کاهش فرآیند ریزغده زایی (در کلیه صفات) شد. محدودیت ریزغده زایی توسط غلظت های بالای پلی اتیلن گلایکول در نتیجه کاهش جذب آب و مواد غذایی توسط ریزنمونه های گره از محیط کشت بود. از طرف دیگر استفاده از غلظت های بالای پلی اتیلن گلایکول به طور معنی داری بر دورمانسی ریزغده ها به منظور مبادله ژرم پلاسم موثر بود. نتایج این پژوهش میتواند به درک بهترمکانیسمهای فیزیولوژیکی مربوط به ریزغده زایی کمک کرده و گامی جهت رسیدن سریع به اهداف اصلاحی باشد.
ریزغده زایی
ساکارز
سیب زمینی
پلی اتیلن گلایکول
2015
08
23
171
184
https://jab.uk.ac.ir/article_1371_47deaba249fe38f8928eab50abb04c49.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1394
7
2
تنوع ژنتیکی اگزون 9 ژن فسفو انول پیروات کربوکسی کیناز میتوکندریایی در سویههای مختلف مرغ با استفاده از تکنیک PCR-RFLP
زهره
یوسفی
قدرت
رحیمی میانجی
زربخت
انصاری
فسفو انول پیروات کربوکسی کیناز، اولین مرحله واکنش را در چرخه گلوکونئوژنز کاتالیز میکند. دو فرم ایزوزیمی از این آنزیم، شامل فسفو انول پیروات کربوکسی کیناز سیتوپلاسمی و فسفو انول پیروات کربوکسی کیناز میتوکندریایی (PEPCK-M) وجود دارد که در سیتوپلاسم و میتوکندری حضور دارند. پژوهش حاضر برای مقایسه چند شکلیهای آللی در جایگاه ژنی PEPCK-M در سویههای مرغ تجاری گوشتی، تخمگذار و مرغهای مولد از ایستگاه اصلاح نژاد مرغ بومی مازندران انجام گرفته است. نمونههای خون به طور تصادفی از 150 قطعه مرغ از این سه جمعیت جمعآوری و استخراجDNA باروش نمکی بهینه یافته انجام شد. یک قطعهی 401 جفت بازی از اگزون 9 ژن PEPCK-Mتکثیر و سپس جهت تعیین ژنوتیپ، محصولات PCR با آنزیم برشی AccI مورد تیمار آنزیمی قرار گرفتند. فراوانی هر یک از آللهای AccI– وAccI+ بهترتیب در مرغ بومی مازندران برابر با 73/0 و 27/0، در مرغ گوشتی برابر با 6/0 و 4/0 و در مرغ تخمگذار برابر با 85/0 و 15/0 محاسبه شد. دو ژنوتیپ AccI-/- و AccI+/- با فراوانی هر یک به ترتیب 46/0 و 54/0 در جمعیت مرغ بومی مازندران، 2/0 و 8/0 در جمعیت مرغ گوشتی و 7/0 و 3/0 در جمعیت مرغ تخمگذار مشاهده شد. مقایسه فراوانی ژنی بین جمعیت مرغهای بومی مازندران با مرغهای گوشتی و تخم گذار اختلاف معنیداری نداشت، اما این اختلاف در بین جمعیت مرغهای گوشتی و تخم گذار از لحاظ آماری معنیدار بود (P<0.05). همچنین مقایسه فراوانی ژنوتیپی بین هر سه جمعیت از لحاظ آماری اختلاف معنیداری را نشان داد(P<0.05) . در نمونههاى مورد مطالعه ژنوتیپ AccI+/+ مشاهده نشد. اختلاف در توزیع ژنوتیپی ممکن است در نتیجه اختلاف در استراتژیهای انتخاب استفاده شده در این جوامع باشد. ﺑﺎ ﺗﻮﺟﻪ ﺑﻪ اینکه ژن PEPCK-M در جمعیتهای مورد بررسی دارای ﭼﻨﺪﺷﮑﻠﯽ ﻗﺎﺑﻞ ملاحظهای ﻣﯽﺑﺎﺷﺪ ﻣﯽﺗﻮان از آن در ﺑﺮﻧﺎﻣﻪﻫﺎی اﻧﺘﺨﺎب و اﺻﻼح ﻧﮋادی آﯾﻨﺪه اﺳﺘﻔﺎده ﻧﻤﻮد
چند شکلی
فسفوانول پیروات کربوکسی کیناز
PCR-RFLP
مرغ بومی
مرغ گوشتی
مرغ تخم گذار
2015
08
23
185
198
https://jab.uk.ac.ir/article_1372_3ded389851f4804540ccdb4364f857bd.pdf