2024-03-28T16:01:42Z
https://jab.uk.ac.ir/?_action=export&rf=summon&issue=359
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
ارزیابی نوع پایه، غلظت ساکاروز و سیستم حمایت کننده محیط کشت در گیرایی و سازگاری ریزپیوندی لیموی آب (Citrus aurantifulia)
زینب
پارسایی
محمد
هدایت
ساسان
راستگو
فرشته
بیات
ریزپیوندی لیموی آب شیراز روی چهار پایه نارنج میوه ریز، نارنج میوه درشت، لیموی آب شیراز و لیمو خارکی در چهار سیستم حمایت کننده محیط کشت شامل پل کاغذی، پرلایت، ورمیکولایت با محیط نیمغلظت MS و پل کاغذی با غلظت کامل MS هر یک به همراه ساکاروز به میزان 60 و 75 گرم در لیتر مورد ارزیابی قرار گرفتند. همچنین سازگاری و رشد گیاهچههای ریزپیوندی در سه نوع بستر کشت پرلایت، ورمی کولایت و پرلایت- ورمیکولایت بررسی شدند. تجزیه آماری ریزپیوندی و سازگاری به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با پنج تکرار انجام شد. براساس نتایج تیمارهای مستقل، بیشترین میزان گیرایی ریزپیوندی نوک شاخساره لیموی آب روی پایههای بذری لیمو خارکی بهدست آمد. همچنین بهترین ریزپیوندی در بالاترین غلظت ساکاروز به میزان 75 گرم بر لیتر محیط کشت مشاهده گردید. در مجموع، بیشترین میزان گیرایی ریزپیوندی نوک شاخساره لیموی آب روی پایههای بذری لیمو خارکی و نارنج میوه درشت در محیط کشتهای پرلایت و پل کاغذی با نیم غلظت MS به همراه 75 گرم بر لیتر ساکاروز بهدست آمد. پس از ریزپیوندی، گیاهچهها از محیط کشتهای درون شیشهای به بستر کاشت انتقال یافتند. حداکثر سازگاری ریزپیوندی بر اساس تعداد برگ و طول پیوندک پس از 5 هفته توسط پایههای بذری لیمو خارکی و نارنج میوه درشت در بسترهای کشت پل پرلایت- ورمیکولایت مشاهده شد.
پایه بذری مرکبات
پرلایت
پل کاغذی
ریزپیوندی
ورمیکولایت
2018
09
23
1
17
https://jab.uk.ac.ir/article_2148_42e6883a6e7c4672123e6a7d58e87528.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
تاثیر پودر آب پنیر و شکل فیزیکی خوراک بر پاسخ ایمنی هومورال و بیان ژنهای اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما در ژنوم جوجههای گوشتی
سونیا
زکی زاده
مریم
ترابی
علی
جوادمنش
علی
زنگنه
محمد حسین
ناظم شیرازی
این طرح جهت بررسی تاثیر پودر آبپنیر و شکل فیزیکی خوراک بر ایمنی هومورال و بیان ژنهای اینترلوکین-4 و اینترفرون گاما روی240 قطعه جوجه خروس یکروزه گوشتی سویه راس 308 انجام شد. آزمایش در قالب طرح کاملا تصادفی در 6 تیمار به روش فاکتوریل (2×3)، آب پنیر در سه سطح (صفر، 4 و 8%) و فرم فیزیکی در دو سطح (آردی و پلت) به جیره جوجههای گوشتی با 4 تکرار و 10 قطعه جوجه در هر تکرار انجام شد. جیرهها بر مبنای احتیاجات جوجه گوشتی سویه راس 308 تنظیم و در سه مرحله پرورش در اختیار پرندگان قرار گرفتند. جهت تعیین تیتر ایمنی علیه نیوکاسل، برونشیت، گامبورو و آنفولانزا در روزهای 10، 31 و 42 خونگیری شد. در پایان هر مرحله یک قطعه جوجه از هر واحد آزمایشی انتخاب و کشتار شد؛ وزن اندامهای لنفاوی یادداشت و بیان ژنهای اینترلوکین-4 و اینترفرونگاما نمونه ژژنوم پس از استخراج mRNA و ساخت cDNA، اندازهگیری شد. مشخص گردید افزودن پودر آبپنیر بر وزن طحال و بورس فابرسیوس اثر معنیدار نداشت، اما پلت کردن در میاندان بر وزن بورس تاثیر معنیدار داشت (01/0p<). پلت کردن و افزودن آبپنیر به جیره در میاندان باعث افزایش بیان نسبی ژن اینترلوکین-4 گردید (05/0p<). بیان ژن اینترفرونگاما تحت تاثیر پودر آبپنیر قرار نگرفت اما پلت کردن، بیان این ژن را در پیشدان (01/0p<) و میاندان افزایش داد (01/0p<).
اندام لنفاوی
ایمنی هومورال
بیان ژن
تیتراسیون واکسن
2018
09
23
19
42
https://jab.uk.ac.ir/article_2149_cfe0fc042fb1443fb9f5ff5a44d83fa1.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
کاربرد الگوریتم uMelt SM در آنالیز منحنی ذوب Real-time PCR
اناهیتا
خارابی ماسوله
عباس
سعیدی
یکی از چالشهای موجود در تفسیر نتایج qPCR ، اطمینان از اختصاصی بودن قطعات تکثیر شده است که برای بررسی آن از آنالیز منحنی ذوب استفاده میشود. پیکهای اضافی در منحنی ذوب همیشه نشان دهنده یک مشکل نیست، به همین منظور در این مقاله یک ابزار مبتنی بر وب به نام uMelt SM به عنوان راهکاری کاربردی و ساده برای آنالیز صحیح منحنی ذوب به محققین پیشنهاد میگردد که امکان پیشبینی منحنی ذوب DNA و پروفیلهای واسرشته سازی را با وضوح بالای فلورسنت از محصولات PCR فراهم میکند. نتایج این مطالعه نشان داد که منحنیهای ذوب براساس چه پارامترهایی تولید شده و الگوریتم مناسب برای نحوه کار با این نرم افزار ارائه گردید. در نهایت ژنهای اکتین و سوپراکسید دیسموتاز از قارچ Pyricularia oryzae به عنوان الگوی مناسب برای تعیین منحنی پیشبینی شده با استفاده از این نرمافزار ارائه گردید و منحنی Real-time PCR نیز ترسیم شد. براساس نتایج منحنی ذوب با استفاده از نرم افزار uMelt SM در مقایسه با منحنی ذوب دستگاه Real-Time PCR تطابق بالایی را نشان میدهد که این نتایج تأییدی بر مزیتهایی همچون سهولت استفاده، صرفهجویی در زمان، هزینه و تلاش در بخش تجربی با استفاده از این نرمافزار میباشد.
qPCR
منحنی ذوب
آزمایش
پیش بینی
uMelt SM
2018
09
23
43
58
https://jab.uk.ac.ir/article_2150_d7eeb631ca4f4b97ac4e8d6a674196fa.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
ارزیابی تنوع ژنتیکی جمعیتهای مختلف آویشن دنایی (Thymus daenensis Celak.) با استفاده از نشانگر ISSR
جلال
خورشیدی
مجید
شکرپور
وحیده
ناظری
ارزیابی تنوع جمعیتهای مختلف یک گونه گیاه وحشی از نخستین و مهمترین گامهای اهلیسازی و اصلاح نژاد آن میباشد. گیاه دارویی آویشن دنایی (Thymus daenensis Celak.) از گیاهان اندمیک ایران بوده که به لحاظ درصد اسانس و نیز تیمول بالای آن از اهمیت ویژهای برخوردار بوده و لذا ارزیابی جمعیتهای مختلف آن در راستای اهلیسازی این گونه گیاهی امری ضروری به نظر میرسد. بدین منظور در این پژوهش از 13 آغازگر ISSR جهت بررسی تنوع درون و بین جمعیتی هشت جمعیت از این گیاه شامل ملایر 1، ملایر 2، اراک، خانهمیران بالا، خانهمیران پائین، زاغه و شازند استفاده گردید که در مجموع 293 باند ایجاد نمودند. محتوای اطلاعات چندشکلی (PIC) محاسبه شده برای آغازگرها از 08/0 تا 15/0 متغیر بود. تنوع درون جمعیتها بسیار بیشتر از تنوع بین جمعیتها بود، طوریکه 98 درصد واریانس مربوط به درون جمعیتها و تنها 2 درصد مربوط به بین جمعیتها بود. فاصله ژنتیکی جمعیتها ارتباط نزدیکی با فاصله جغرافیایی آنها نداشت. جمعیت جوزان دارای بیشترین و جمعیت شازند دارای کمترین تنوع بر اساس شاخص PIC بودند. بیشترین فاصله ژنتیکی بر اساس شاخص نی بین دو جمعیت شازند و خانه میران پایین و بیشترین تشابه ژنتیکی بین جمعیت ملایر 1 با جوزان و خانه میران بالا مشاهده شد که میتواند در اهلیسازی و اصلاحنژاد آویشن دنایی حائز اهمیت باشد.
آویشن دنایی
اندمیک
تنوع
ISSR
2018
09
23
59
74
https://jab.uk.ac.ir/article_2151_ec010841458674434de73558cb9289ec.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
بهینهسازی کالوسزایی و باززایی گیاه خیار (Cucumis Sativus L.) با استفاده از ریزنمونههای کوتیلدون، هیپوکوتیل و برگ
مریم
عبدلی نسب
رقم سوپرنیا خیار یکی از ارقام مهم هیبرید وارداتی با عملکرد بالا میباشد. به منظور بهینه کردن تکثیر غیرجنسی این رقم از طریق کشت درون شیشهای، ریزنمونههای مختلف کوتیلدون، هیپوکوتیل و برگ در محیط پایه موراشیگ و اسکوگ MS)) تحت أثر غلظتهای صفر، 1/0، 2/0، 3/0 و 4/0 میلیگرم در لیتر هورمون 1- نفتالن استیک اسید (NAA) در ترکیب با غلظتهای 1، 2، 3 و 4 میلیگرم در لیتر هورمون 6- بنزیل آمینوپورین (BAP) قرار گرفت. آزمایش به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملا تصادفی در سه تکرار و تعداد پنج ریزنمونه در هر تکرار انجام گردید. درصد کالوسزایی، درصد کالوسهای رویانزا و فراوانی تولید نوساقه در ریزنمونههای کشت شده مورد ارزیابی قرار گرفت. بیشترین میزان کالوسزایی (6/86 درصد) در ریزنمونه کوتیلدون در تیمار هورمونی 3/0 میلیگرم در لیتر NAA به همراه 3 میلیگرم در لیتر BAP، بیشترین درصد کالوسهای رویانزا (6/61 درصد) در ریزنمونه هیپوکوتیل در تیمار هورمونی 2/0 میلیگرم در لیترNAA به همراه 2 میلیگرم در لیتر BAP و بیشترین تعداد نوساقه (08/20) در ریزنمونه کوتیلدون در تیمار هورمونی 3/0 میلیگرم در لیتر NAA به همراه 3 میلیگرم در لیتر BAP مشاهده گردید. نوساقههای باززا شده جهت القا و تشکیل ریشه به محیط MS ½ حاوی 1 میلیگرم در لیتر هورمون NAA منتقل و سپس گیاهچههای رشدیافته به محیط خارج آزمایشگاه سازگار گردیدند. بر اساس نتایج این مطالعه، استفاده از ریزنمونه کوتیلدون جهت ریزازدیادی و باززایی این ژنوتیپ بهخصوص در مطالعات انتقال ژن توصیه میگردد.
ریزازدیادی
کشت درون شیشهای
خیار
NAA
BAP
2018
09
23
76
92
https://jab.uk.ac.ir/article_2152_a783c6a6170b996c77cea09b26a306cd.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
جداسازی ملکولی cDNA کدکننده N-methylstylopine hydroxylase از مامیران کبیر (Chelidonium majus L.) و افزایش بیان آن در پاسخ به محرک غیرزیستی شوری
زهرا
سلیمانی
صدیقه
فابریکی اورنگ
سودابه
مفاخری
مامیران کبیر (Chelidonium majus L.) حاوی ترکیبات آلکالوئیدی مهم از جمله سنگوئینارین است. سنگوئینارین یک آلکالوئید فعال دارای خواص دارویی بالقوه ضدمیکروبی، ضدالتهابی و ضدتوموری میباشد که بهطور گسترده در گیاهان خانواده خشخاش وجود دارد. در این تحقیق جداسازی و تعیین توالی cDNA کد کننده آنزیم (s)-cis-N-methylstylopine 14-hydroxylas (MSH) در مامیرانکبیر بهعنوان یکی از آنزیمهای کلیدی مسیر تولید سنگوئینارین انجام شد. سپس تغییرات بیان ژن cmMSH در سه اندام ریشه، برگ و ساقه در چهار سطح شوری (صفر، 25، 50 و100 میلیمولار) بهصورت فاکتوریل در قالب طرح پایه کاملاً تصادفی بررسی شد. در پژوهش حاضر cDNA کد کننده آنزیم cmMSH از بافت ریشه جداسازی، با موفقیت در ناقل پلاسمیدیPTG19-T درج و سپس در باکتری E .coli همسانهسازی شد. پس از تأیید همسانههای نوترکیب با روش PCR، پلاسمید باکتریهای نوترکیب استخراج و قطعه ژنی توالییابی شد. قطعه توالییابی شده دارای 784 نوکلئوتید با یک چارچوب قرائت باز 261 اسیدآمینهای بود و مشخص گردید پروتئین حاصل با داشتن دامینهای کارکردی helix K region، heme-binding region و aromatic region متعلق به خانواده پروتئینی Cytochrome-P450 میباشد. در درخت فیلوژنی، توالی پروتئینی ژن cmMSH جداسازی شده بیشترین شباهت را با آنزیم methylstylopine 14-hydroxylase گیاه خشخاش داشته است. مقایسه میانگین بیان نسبی ژن نشان داد که شوری50 میلیمولار بیشترین تأثیر را بر افزایش بیان ژن cmMSH در بافت ریشه دارد. همچنین بررسی الگوی تغییرات بیان ژن نشان داد که با افزایش سطح شوری تا 50 میلیمولار، بیان ژن cmMSH در دو اندام برگ و ریشه زیاد شده و با افزایش شدت شوری به 100 میلیمولار میزان بیان ژن بهمقدار 35 درصد در هر دو اندام کاهش یافت.
آنزیمcmMSH
بنزیلایزوکوئینولینها
سنگوئینارین
شوری
مامیران
2018
09
23
94
107
https://jab.uk.ac.ir/article_2153_5e529a1e9634a1d82f6e4ef726603ef4.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی ژنوتیپهای نخود کابلی با استفاده از نشانگرهای ISSR
مهدیه
لری نژاد
مهدی
مهیجی
روح الله
عبدالشاهی
علی
کاظمی پور
داود
صادق زاده اهری
نخود مهمترین گیاه تیره حبوبات در ایران است و از آنجا که ایران بخشی از مرکز تنوع این گیاه به شمار میآید مطالعه تنوع ژنتیکی آن حایز اهمیت است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی نخود کابلی 81 ژنوتیپ نخود کابلی از سه مبداء موسسه ایکاردا، ترکیه و ایران در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه شهید باهنر کرمان در سال زراعی 94-93 کشت شد. از نه آغازگر ISSR برای بررسی تنوع استفاده شد و 79 نوار چندشکل از آغازگرهای مورد استفاده به دست آمد. تعداد آلل موثر از 19/1 (آغازگر (CAC)5AG) تا 69/1 (آغازگر (ACTG)4) متغیر بود. متوسط ضریب تنوع ژنتیکی نی و شاخص شانون در کل جمعیت به ترتیب 24/0 و 38/0 به دست آمد. ضریب تنوع نی برای جمعیتهای مبداء ایکاردا، ترکیه و ایران به ترتیب 27/0، 2/0 و 2/0 و شاخص شانون برای این جمعیتها به ترتیب 44/0، 32/0 و 3/0 به دست آمد. تجزیه واریانس مولکولی تفاوت میان جمعیتها را معنی دار نشان داد. ولی واریانس بین جمعیتها تنها ده درصد کل واریانس بین ژنوتیپها را به خود اختصاص داد. تجزیه خوشهای ژنوتیپها را به چهار گروه تقسیم کرد. نتایج تجزیه خوشهای نیز موید گستردگی تنوع درون جمعیتها بود. تجزیه ساختار جمعیت با استفاده از نرم افزار STRUCTRE جمعیت را به چهار گروه با تعداد 14، 5، 8 و 4 ژنوتیپ برای هر گروه تقسیم کرد. تعداد 51 ژنوتیپ باقی مانده نیز به عنوان ژنوتیپهای مخلوط در نظر گرفته شدند. این پژوهش نشان داد که تنوع ژنتیکی مطلوبی میان ژنوتیپهای نخود کابلی مورد مطالعه در این تحقیق وجود دارد که میتواند در برنامههای بهنژادی مورد استفاده قرار گیرد.
نخود
تنوع ژنتیکی
تجزیه واریانس مولکولی
نشانگر ISSR
2018
09
23
109
128
https://jab.uk.ac.ir/article_2154_10f5d3849c341df68e3b338ab467084d.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
شناسایی نشانگرهای DNA مرتبط با ویژگی های فیتوشیمیایی میوه سماق (Rhus coriaria L.)
رسول
محمدی آلاگوز
رضا
درویشزاده
احمد
علیجانپور
حمید
حاتمی ملکی
راحله
ابراهیمی
سماق (Rhus coriaria L.) که در ایران و خاورمیانه به عنوان یکی از ادویه های غذایی مهم شناخته می شود دارای اجزاء دارویی نظیر اسیدهای آلی، اسیدهای فنولی، فلاونوئیدها، آنتوسیانین ها، تانن ها و ترپنوئیدها می باشد. این گیاه از گونههای مهم جنگلی است که پراکنش مناسبی در شمال غرب ایران دارد. در این بررسی، نمونه های برگ و میوه مربوط به 15 ژنوتیپ سماق از هریک از 5 ناحیه واقع در شمال غرب کشور به منظور انگشت نگاری با نشانگر ISSR و نیز اندازه گیری ترکیبات مالیک اسید، پروتوکاتکوئیک اسید و کوماریک اسید از طریق تکنیک LC-MS/MS مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج آماره های توصیفی بیانگر وجود تنوع ژنتیکی در ژرم پلاسم سماق مورد مطالعه از نظر ویژگی های فیتوشیمیایی می باشد. در مورد مالیک اسید و کوماریک اسید تنوع بین جمعیتی بیشتر از تنوع درون جمعیتی بود. مطالعه ساختار جمعیت مربوط به 75 ژنوتیپ سماق با استفاده از داده های 18 آغازگر ISSR شامل 132 نشانگر ISSR و در نرم افزار Structure آن ها را در دو زیرجمعیت مختلف قرار داد. نتایج تجزیه ارتباطی نشان داد که نشانگرهایUBC867، UBC801 وUBC864 به ترتیب دارای ارتباط معنی دار با نواحی ژنومی کنترل کننده مالیک اسید، کوماریک اسید و پروتوکاتکوئیک اسید هستند. نشانگرهای شناسایی شده در این تحقیق در صورت تایید می توانند در برنامه به نژادی بواسطه گزینش به کمک نشانگر در سماق بکار گرفته شوند.
سماق
تنوع ژنتیکی
LC-MS/MS
تجزیه ارتباطی
2018
09
23
130
142
https://jab.uk.ac.ir/article_2155_ec740987b86593e01211fb3264dfb2b2.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
تجمع رونوشت ژن-های PALو PR-1 قبل از مواجهه با آلودگی پوسیدگی بلال در ذرت، عاملی موثر در مقاومت به قارچ فوزاریوم
حجت الله
مظاهری لقب
حسن
سلطانلو
افشین
مساوات
پوسیدگی فوزاریومی بلال با عامل Fusarium verticillioides یکی از مهمترین بیماریهای ذرت در سراسر دنیا میباشد. گیاهان از طریق فعالسازی راهبردهای دفاعی پیچیده به حمله پاتوژنها پاسخ میدهند. پاسخ دفاعی به عفونت پاتوژن شامل تغییرات در بیان شمار زیادی از ژنهای گیاه است که ممکن است بیان ژن افزایش یا کاهش یابد. سه لاین با سطح مقاومت متفاوت به قارچ فوزاریوم (C7, B73, MO17) در قالب طرح بلوک کامل تصادفی کشت شدند. بعد از ظهور ابریشم، گرده افشانی دستی انجام گرفت و 15 روز پس از آن مایهزنی با قارچ فوزاریوم با استفاده از سرنگ (آلوده سازی دانه) و سرسرنگ (آلوده سازی ابریشم) انجام گرفت. سپس در 12، 24، 48، 72 و 96 ساعت پس از آلودگی نمونهبرداری از ابریشم و دانه ذرت صورت گرفت. بلال تلقیح نشده به عنوان شاهد استفاده شد. بعد از استخراج RNA و ساخت cDNA ، با استفاده از تکنیک Real-time PCR الگوی بیان نسبی ژنهای PAL و PR-1 اندازهگیری و دادهها با استفاده از نرم افزار REST تجزیه شدند. همه ژنوتیپها قادر به بیان ژنهای PAL و PR-1 بعد از آلودگی به قارچ فوزاریوم هستند و تنها تفاوت آنها در سطح بیان ژنها است. تغییرات عمده در بیان ژنهای دفاعی در لاین مقاوم و حساس قبل از آلودگی اتفاق میافتد. لاین مقاوم قبل از ایجاد آلودگی دارای سطح بالایی از بیان ژنهای PAL و PR-1 است و شاید همین به عنوان مانع اولیه در برابر حمله پاتوژن عمل کند ولی لاین حساس نسبت به لاین مقاوم، بعد از آلودگی بیان ژنهای PAL و PR-1 را آغاز میکند.
بیان ژن
ذرت
قارچ فوزاریوم
PAL
PR-1
2018
09
23
145
164
https://jab.uk.ac.ir/article_2156_8dccfc25bcb5afc38b9c584b17dfe978.pdf
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
بیوتکنولوژی کشاورزی
2228-6705
2228-6705
1397
10
2
تنوع نوکلئوتیدی ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای در ژنوتیپهای مقاوم و حساس گندم نان
رحیمه
همتی گوگه
ابوالقاسم
محمدی
سعید
اهری زاده
زنگ قهوهای (Leaf rust) یکی از بیماریهای مهم گندم در سطح جهان است که اپیدمی آن منجر به کاهش عملکرد و کیفیت گندم نان میشود. در این مطالعه، تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی ژنهای مقاومت به زنگ قهوهایLr1، Lr21، Lr51 وLr39 در هفت ژنوتیپ گندم نان با واکنش متفاوت به زنگ قهوهای بررسی گردید. ژنهای مقاومت به زنگ قهوهای و یا نواحی پیوسته با این ژنها با استفاده از آغازگرهای اختصاصی طراحی شده بر اساس توالیهای موجود در بانکهای اطلاعاتی تکثیر شدند. قطعات تکثیری در باکتری E. coli همسانهسازی و توالییابی گردیدند. همردیف کردن توالی ژنهای مورد مطالعه با توالیهای موجود در بانک اطلاعاتی NCBI، شباهت بالای آنها را با توالی ژنهای مقاومت از جمله ژنهای خانواده NBS-LR و RGAها نشان داد. همردیفی قطعات تکثیر شده از ژنهای مورد مطالعه با توالیهای موجود در NCBI نشان دهنده شباهت قطعه تکثیر شده از ژن Lr51، با ژن agp2 بود. توالی ژن Lr39 با ژن VRN1، مسئول بهارهسازی در گندم زمستانه، 88 شباهت درصد داشت. نتایج بدست آمده از همردیف کردن توالیها و گروهبندی آنها، حاکی از وجود تغییرات ساختاری و تنوع نوکلئوتیدی این ژنها در ارقام مورد مطالعه بود. نسبت جایگزینیهای همنام به ناهمنام Ka/Ks)) در قطعات تکثیر شده از ژن Lr1 با استفاده از جفت آغازگرهای Lr1-2، Lr1-3 وLr1-4 و ژنهای Lr21 وLr39 کوچکتر از یک و نشان دهنده گزینش منفی برای جایگزینی یک اسیدآمینه در این ناحیه از این ژنها بود. در قطعه ژن تکثیر شده از ژن Lr1 با استفاده از جفت آغازگر Lr1-5 نسبت Ka/Ks بیشتر از یک و نشان دهنده گزینش مثبت یا گزینش در جهت ایجاد تنوع برای جایگزینی یک اسیدآمینه است. از نظر توالی ژنهای Lr1، Lr21، Lr39 وLr51، ژنوتیپهای مورد مطالعه فقط از نظر چند نوکلئوتید تفاوت داشتند که براساس این تفاوتهای نوکلئوتیدی میتوان آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر SNPها جهت شناسایی ژنوتیپهای حساس و مقاوم طراحی کرد.
زنگ قهوهای
تنوع نوکلئوتیدی
ژنهای مقاومت به بیماری
2018
09
23
163
186
https://jab.uk.ac.ir/article_2157_578d8ddaf0d2b29bd6a914610a80a4cc.pdf