دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 5 1 2013 05 22 Monitoring of grain length gene (GS3) in composite cross populations of rice by molecular marker ردیابی ژن عامل طول دانه برنج (GS3) در جمعیتهای تلاقی مرکب با استفاده از نشانگرهای مولکولی 159 170 1196 10.22103/jab.2013.1196 FA کاملیا کتالاتی قربانعلی نعمت زاده غفار کیانی سید حمید رضا هاشمی Journal Article 2011 11 28 Grain appearance quality mainly, is defined by grain length, grain width and long to width rations, which have an important role in marketability. Since determination of grain shape in the early stage of growth is not possible, marker assisted selection is a basic step to improve the quantitative and qualitative traits in rice. In this study, two local high quality rice cultivars (Shastak and Domsiah) and two improved high yielding rice varieties (Fajr and Nemat) were used to improve the quality-related traits in new released variety (Ghaem), through classical methods and MAS. For the MAS, firstly the accuracy of the GS09 primer was confirmed by utilizing <em>in silico</em> studies and analyzing correlation of banding pattern with parental phenotype. Thus shastak variety with short grain phenotype created unique banding patterns than other parents. Banding patterns of <em>GS3</em> in the cross 1 (Fajr / Ghaem // Shastak / Ghaem), cross 3 (Nemat / Ghaem // Shastak / Ghaem) and cross 4 (Shastak / Ghaem // Domsia / Ghaem) were used for distinction the heterozygous plants containing shastak allele (unfavorable) from other plants. Therefore, long grain plants should be studied for achieving pure lines in progressive generations. The results indicated that the <em>GS3</em> locus markers can be used as a quick and inexpensive method to improve the quality of grain length. کیفیت ظاهری دانه برنج عمدتا شامل طول دانه و نسبت طول به عرض می­باشد و سهم به سزایی در بازارپسندی محصول دارد. با توجه به اینکه تعیین فنوتیپ شکل دانه در مراحل اولیه رشد گیاه میسر نمی­باشد انتخاب به کمک نشانگرهای مولکولی گامی اساسی در جهت بهبود صفات کمی و کیفی برنج می­باشد. در این تحقیق به منظور ترمیم صفات کمی و کیفی رقم جدید قائم، از دو رقم محلی شصتک و دمسیاه و دو رقم اصلاح شده فجر و نعمت به عنوان والد در تلاقی­ها استفاده گردید. جهت اجرای MAS در لاین­های حاصل از تلاقی­های مرکب، ابتدا کارایی نشانگر <em>GS3</em> به کمک مطالعات بیوانفورماتیکی (<em>In silico</em>) و بررسی همبستگی الگوی باندی با فنوتیپ والدین تایید گردید. بدین نحو که رقم شصتک با خصوصیات دانه گرد، نسبت به سایر والدین الگوی باندی منحصر به فردی ایجاد نمود. از الگوی باندی نشانگر <em>GS3</em> در تلاقی­های مرکب شماره 1 (فجر / قائم// شصتک / قائم)، تلاقی شماره 3 (نعمت / قائم// شصتک / قائم) و تلاقی شماره 4 (شصتک / قائم // دمسیاه/ قائم) جهت تمایز بوته­های هتروزیگوس دارای آلل شصتک (نامطلوب) از سایر بوته­ها (دانه کشیده) استفاده گردید. شایان ذکر است برای دستیابی به لاین­های خالص، بوته­های دانه بلند انتخابی می­بایست در نسل­های پیشرفته­تر مورد بررسی قرار گیرند. نتایج این تحقیق نشان می­دهد که از نشانگر مکان ژنی <em> GS3</em> می­توان به عنوان روشی سریع و کم هزینه جهت بهبود کیفیت طول دانه استفاده نمود. https://jab.uk.ac.ir/article_1196_9adeb82fffb5444e81fa0ce8ad8afe7a.pdf