دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 6 1 2014 05 22 Full-length genome sequencing and phylogeny of severe strain isolates of Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV-IL) originating from Datura stramonium L. in Bojnurd region, Iran تعیین توالی ژنوم کامل و فیلوژنی جدایه های نژاد شدید ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی جدا شده از تاتوره Datura stramomum L. در منطقه بجنورد، ایران 61 76 1293 10.22103/jab.2014.1293 FA محمدرضا حسین زاده مسعود شمس بخش کاظم پور اوصالو Journal Article 2013 01 14 <em>Tomato yellow leaf curl virus </em>(TYLCV) and  a complex of  ten virus species and their strains referred to as TYLCV-like viruses cause damage on tomato (<em>Solanum  lycopersicum</em> L.) crops in tropical, subtropical and temperate regions of the world.  In this study, full-length genome of three TYLCV-IL isolates originating from <em>Datura stramonium</em> L. in Bojnurd region, Iran were cloned, sequenced  and subsequently entered the phylogenetic analysis with nine TYLCV-IL isolates from Iran and eight selected begomoviruses of tomato from Iran and other part of  the world. The phylogenetic analysis suggested the geographical-dependent evolution of Iranian TYLCV-IL populations so that regardless of host species the monophyletic group of the northeastern and southern isolates was clustered separately into two subgroups. TYLCV-IL [IR: Sh40:07], GU076444 isolated in Shiraz region was not clustered with none of the Iranian TYLCV-IL isolates but rather was grouped with the type strain of TYLCV-IL from Israel in a separate group. Evolutionally, this isolate could be a “genetic bridge” between Mediterranean and Iranian TYLCV-IL isolates. This is the first report of <em>Datura stramonium</em> L. as the host species of TYLCV-IL in Iran and also the first-time occurrence of the viral stain in North Khorasan province, Bojnurd, Iran. ویروس پیچیدگی زرد برگ گوجه فرنگی , TYLCV) <em>Tomato yellow leaf curl virus</em>) به همراه ده گونه ویروسی و نژادهایشان که به ویروس­های شبه TYLCV معروفند عامل خسارت به گوجه فرنگی (<em>Solanum</em> <em>lycopersicum</em> L.) در مناطق گرمسیر، نیمه گرمسیر و معتدل دنیا می باشند. در این بررسی تعداد سه جدایه TYLCV-IL از گیاهان تاتوره در منطقه بجنورد همسانه سازی و ژنوم کامل آنها تعیین توالی گردید.  توالی اسید نوکلئیک ژنوم کامل آنها به همراه تعداد نه جدایه TYLCV-IL  گزارش شده ازایران و هشت  توالی سایر ویروس­های <em>Begomovirus</em> گوجه فرنگی از ایران  و سایر مناطق دنیا  مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج فیلوژنی جدایه­ها نشان داد که تکامل جمعیت نژاد TYLCV-IL در ایران وابسته به جغرافیا بوده و صرفنظر از گونه میزبان واریانت­های شمال شرق و جنوب ایران به طور مجزا در دو زیرگروه جداگانه قرار گرفتند. جدایه TYLCV-IL[IR:Sh40:07], GUO76444 از منطقه شیراز با هیچکدام از جمعیت­های شمال شرق و جنوب ایران گروه بندی نشد. این جدایه با نژاد تیپ TYLCV-IL گزارش شده از فلسطین اشغالی قرابت نزدیکی داشته و با یکدیگر در یک زیر گروه مجزا قرار گرفتند. نتایج تجزیه فیلوژنی نشان داد که این جدایه از نظر تکاملی به عنوان پل ژنتیکی بین جدایه­های TYLCV-IL حوزه مدیترانه­ای و ایران محسوب می­شود. این اولین گزارش از گیاه تاتوره به عنوان میزبان  نژاد TYLCV-IL  در ایران و همچنین حضور این نژاد ویروسی در منطقه بجنورد و استان خراسان شمالی  می­باشد https://jab.uk.ac.ir/article_1293_aaeab4b4ed13578f00765717b1490230.pdf