دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 12 2 2020 08 22 Genetic and phylogenetic analysis of 12S rRNA region in camelus dromedaries and camelus bactrianus of Iran تجزیه و تحلیل ژنتیکی ناحیه 12S rRNA شترهای تک‌کوهانه و دوکوهانه ایران 209 223 2679 10.22103/jab.2020.16089.1246 FA آزاده ترابی استادیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، زهرا رودباری عضو هیات علمی دانشگاه جیرفت مجتبی طهمورث پور دانشگاه فردوسی مشهد Journal Article 2020 07 15 Objective Around the world, scientists are looking for new animal protein sources and trying to prioritize the animals with the best conversion rates. One of these animals is Camel. Identification of genetic differences in sequences of Mitochondrial Genome by Bioinformatics Tools is a rapid and confident method for identification and categorizing species. This method is one of the most effective ways of evaluating genetic biodiversity and Phylogenetic relationships in different livestock like Camel. This research was done for sequencing of Ribosomal non-coding RNA gene and comparison of its genetic construction between camelus dromedaries and camelus bactrianus of Iran. Materials and Methods We were collecting blood samples from twenty camelus dromedaries and camelus bactrianus. We extracted DNA at the beginning then 12S rRNA with 1326 pair bases was amplified and sequenced by two pair specific primers. Results The Presence of 3 Haplotypes in Bactria camels and one haplotype in Dromedary were proved in the study population. These Haplotypes have two single nucleotide polymorphism (SNP) site in camelus bactrianus and there was not any Nucleotides difference among camelus dromedaries. Phylogeny Tree design with using similar mitochondrial 12S rRNA gene sequencing in other species which are in World Gene Bank. Conclusion Phylogeny Analysis and defining, Genetic diversity was showing camelus dromedaries and camelus bactrianus are placing in two different groups and Iranian camelus bactrianus have more Genetic Diversity which indicates more historical evolution of this specie. More information about Genetic diversity among the different generation of Camels can facilitate developing generations revising Programs and is a necessity for protecting from Genetic Resources. هدف: دانشمندان علوم دامی در سرتاسر جهان در پی یافتن منابع جدیدی از پروتئین حیوانی بوده و تلاش می‌کنند تا حیواناتی که بهترین ضریب تبدیل را دارند در اولویت کاری خود قرار دهند. از جمله این دام‌ها می‌توان به شتر اشاره کرد. تحقیقات جهت حفظ این ذخیره ژنتیکی با ارزش از حساسیت و اهمیت بیشتری برخوردار است. شناسایی تفاوت‌های ژنتیکی در توالی ژن‌های موجود در ژنوم میتوکندری با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک، روشی سریع و قابل اطمینان برای شناسایی و طبقه بندی گونه‌ها است و یکی از مؤثرترین ابزارها در برآورد تنوع زیستی ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک در نژادهای مختلف دام از جمله شتر محسوب می‌شود. هدف از انجام این پژوهش توالی‌یابی و مقایسه ساختار ژنتیکی ژن RNA غیر کدکننده زیر واحد کوچک ریبوزوم در شترهای تک‌کوهانه و دوکوهانه ایران بود. مواد و روش‌ها: برای انجام این پژوهش از 20 نفر شتر تک‌کوهانه و دو‌کوهانه ایرانی نمونه خون جمع‌آوری شد. پس از استخراج DNA ژن 12S rRNA با طول 1326 جفت باز در ژنوم میتوکندری توسط دو جفت آغازگر اختصاصی تکثیر و توالی‌یابی شدند. نتایج: وجود 3 هاپلوتایپ در شترهای دوکوهانه و 1 هاپلوتایپ در شترهای تک‌کوهانه در جمعیت مورد پژوهش ثابت شد که این هاپلوتایپ‌ها به ترتیب دارای دو جایگاه چند شکل (SNP) در شتر دو کوهانه است و در بین شترهای تک‌کوهانه هیچ تفاوت نوکلئوتیدی مشاهده نشد. درخت فیلوژنی پس از اخذ توالی‌های مشابه ژن 12S rRNA میتوکندری دیگر گونه‌های موجود در بانک جهانی ژن با استفاده از آنها ترسیم شد. نتیجه‌گیری: نتایج تجزیه و تحلیل فیلوژنی و تنوع ژنتیکی نشان داد گونه‌های شتر تک‌کوهانه و دو‌کوهانه در دو گروه متفاوت قرار دارند و شترهای دو‌کوهانه ایرانی تنوع ژنتیکی بالاتری دارند که نشان از قدمت تکاملی طولانی‌تر این گونه دارد. اطلاعات در مورد تنوع ژنتیکی در میان نژادهای شتر می‌تواند توسعه برنامه‌های اصلاح نژاد را تسهیل کند و یک الزام برای حفظ منابع ژنتیکی است.

https://jab.uk.ac.ir/article_2679_6f82b7823082a475fee17076c9350de8.pdf