دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Designing of polyoleosin-proinsulin fusion gene and its transformation to rapeseed (Brassica napus L.) طراحی تلفیق ژنی پلی‌اولئوزین-پروانسولین و انتقال آن به گیاه کلزا (Brassica napus L.) 1 16 2204 10.22103/jab.2018.2204 FA نجمه آیت فرد کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، خوزستان، ایران. اسماعیل قاسمی گوجانی استادیار گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، خوزستان، ایران. علیرضا شافعی‌نیا استادیار گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، خوزستان، ایران. پیام پورمحمدی استادیار گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، خوزستان، ایران. Journal Article 2018 06 19 Objective The use of plant Oleosin gene is a recommended method for large-scale, easier and cheaper production of recombinant protein. Attachment of oleosin gene to target gene cause to accumulate recombinant protein on seed oil bodies surface. Recent researches indicate that application of tandem Oleosin Genes (polyoleosin) fused to the target gene to facilitate recombinant protein purification is more efficient than single Oleosin. Materials and methods In present research, we designed a synthetic fusion fragment containing 5´- Kozak sequence - His-tags, three Oleosin Genes, a proteolytic site for a peptidase enzyme, Proinsulin protein, and a tetranucleotide stop codon. This synthetic sequence was cloned in binary vector pBI121by enzymatic digestion and ligation method. Then for transformation of cotyledon and hypocotyl explants of Canola, confirmed recombinant construct is transformed to Agrobacterium LBA4404 strain. Probable transgenic shoots were regenerated on selective medium containing kanamycin after 4-6 weeks. Results The analysis of transgenic shoots at DNA level was performed by PCR and amplification of a 120-bp fragment indicate integration of fusion gene in transgenic plant genome. Finally, the Proinsulin gene transcription was also confirmed by RT- PCR. هدف: استفاده از ژن اولئوزین گیاهی یک روش مناسب برای تولید و تجمع پروتئین نوترکیب در مقیاس زیاد و همچنین استخراج راحتتر و ارزانتر میباشد. اتصال اولئوزین به ژن موردنظر، موجب هدفگیری پروتئین نوترکیب به اجسام روغنی بذر میشود. در سالهای اخیر، به منظور افزایش کارایی اولئوزین در تولید پروتئین نوترکیب، چند ژن اولئوزین (پلیاولئوزین)، به ژن هدف متصل میشود. این امر سبب تولید و تجمع پروتئین نوترکیب در سطوح اقتصادی در بذر میگردد. مواد و روشها: از اینرو برای افزایش میزان تجمع پروتئین پروانسولین در بذر گیاه کلزا، یک سازهی تلفیقی پلیاولئوزین-پروانسولین طراحی و ساخته شد. در طراحی این توالی به ترتیب از سمت /5 توالی، یک توالی کزاک، یک برچسب هیستیدین، سه ژن اولئوزین، یک جایگاه پروتئولیتیکی برای پروتئاز، ژن پروانسولین و یک کدون پایان تترانوکلئوتید قرار گرفت. این تلفیق ژنی پس از سنتز در ناقل pUC57 قرار داده شد. تلفیق ژنی، پس از هضم آنزیمی به وسیلهی آنزیمهای BamHI و SacI از pUC57 جداسازی و در ناقل دوتایی pBI121 همسانهسازی گردید. پس از تائید درج تلفیق ژنی در ناقل pBI121 با استفاده از روشهای PCR، هضم آنزیمی و توالییابی، ناقل نوترکیب به سویهی LBA4404 اگروباکتریوم انتقال داده شد. این باکتری برای تراریختی ریزنمونههای کوتیلدون و هیپوکوتیل کلزا مورد استفاد قرار گرفت. نوساقههای باززایی شده در محیط انتخابی حاوی کانامایسین گزینش شدند. نتایج: آنالیز گیاهان تراریخته در سطح DNA با استفاده از روش PCR انجام و یک قطعهی 120 جفت بازی (مطابق با بخشی از ژن پروانسولین) تکثیر شد. همچنین تکثیر این قطعهی 120جفتبازی با روش RT-PCR، بیانگر بیان ژن هدف در گیاهان تراریخته بود.

https://jab.uk.ac.ir/article_2204_736358496abd6f29bcecad979cd796de.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Optimization of Direct Regeneration of Astragalus verus in in vitro condition بهینه‌سازی باززایی مستقیم گون (Astragalus verus ) در شرایط درون شیشه‌ای 17 30 2205 10.22103/jab.2018.2205 FA صفیه ابراهیمی دانش اموخته کارشناسی ارشد بیوتکنولوزی کشاورزی، مجتمع آموزش عالی شیروان، خراسان شمالی، ایران. فاطمه ذاکر تولایی استادیار بیوتکنولوژی کشاورزی و عضو هیأت علمی مجتمع اموزش عالی محمد زارع مهرجردی استادیار بیوتکنولوژی کشاورزی و عضو هیأت علمی مجتمع اموزش عالی شیروان، خراسان شمالی، ایران. محمود قربانزاده نقاب دانشیار بیوتکنولوژی کشاورزی و عضو هیأت علمی مجتمع اموزش عالی شیروان، خراسان شمالی، ایران. Journal Article 2018 06 13 Astragalus is one of the most valuable medicinal plants in Iran. The species of Astragalus verus is a native species of tragacant producer. Due to the importance of this species in the production of tragacant, exposed to extinction, the role of seed in its reproduction, as well as the possibility of its reproduction using micropropagation, this study was conducted with the aim of breaking seed dormancy, seed germination and direct regeneration of this plant. First, the effect of surface scratching on breaking of seed dormancy was investigated. Then, the effect of culture medium and sucrose concentration on seed germination and sterile seedling production was studied as factorial based on completely randomized design. The explants of hypocotyle and epicotyle were cultured on MS medium supplied by B5 vitamin containing BAP in 3 levels and IAA in 2 levels due to multiple shoot production. Rooting of multiple shoots was carried out on 1/2MS medium containing IAA in 2 levels and IBA in 3 levels based on completely randomized design with 6 treatments and 5 repeat.Scraping increased the germination rate by an average of 98%. Different media and sucrose concentration had no effect on germination percentage. With increasing sucrose, were increased the stem and root length, fresh weight and seedling dry weight. The highest percentage of shoots was obtained in MS medium containing 2 mg /L BAP without IAA with an average of 4.6 pcs. The highest percentage of rooting was obtained with 1.5 mg/l IAA with an average of 60%. The results of this study can be used in micropropagation, gene transformation and in vitro tragacant production. گون از گیاهان دارویی وصنعتی با ارزش در ایران است و گونهAstragalus verus از گونههای بومی مولد کتیرا میباشد. با توجه به اهمیت این گونه در تولید کتیرا و در معرض انقراض قرار داشتن آن این مطالعه با هدف دست یابی به روشی سریع برای تکثیر آن برمبنای شکستن خواب بذرو جوانهزنی و باززایی مستقیم گیاه در شرایط این ویترو انجام شد. ابتدا تاثیر خراش دادن سطحی در شکستن خواب بذرها بررسی شد. سپس تاثیر نوع محیط کشت و غلظت ساکارز در جوانهزنی بذرها و تولید گیاهچه استریل در قالب طرح کاملا تصادفی به صورت فاکتوریل بررسی گردید. ریزنمونههای محور زیرلپه و بالایلپه جهت شاخهزایی چندگانه در محیط کشت MS غنی شده با ویتامین B5 حاوی ترکیب هورمونی BAP در سه سطح و IAA در دو سطح کشت شدند. ریشهزایی شاخههای چندگانه در محیط کشت MS2/1 با ترکیب هورمونی IAA در دو سطح و IBA در سه سطح در قالب طرح پایه کاملا تصادفی با شش تیمار و پنج تکرار بررسی شد. خراشدهی باعث افزایش میزان جوانه‌زنی با میانگین 98 درصد شد. غلطتهای مختلف محیط کشت و ساکارز تاثیری روی درصد جوانهزنی نداشت. با افزایش ساکارز طول ساقه و ریشه، وزن تر و وزن خشک گیاهچه افزایش یافت. بیشترین درصد شاخهزایی در محیط کشت MS حاوی دو میلیگرم در لیتر BAP بدون IAA با میانگین 6/4 عدد و بیشترین درصد ریشهزایی در محیط کشت MS2/1 با 5/1 میلیگرم در لیتر IAA با میانگین 60 درصد بدستآمد. نتایج این پژوهش میتواند در ریزازدیادی، انتقال ژن و تولید درونشیشهای کتیرا در آینده استفاده شود.

https://jab.uk.ac.ir/article_2205_e87a0b7f7b1aac3fc72d90d1f9740075.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Study on antibacterial activity and cytotoxicity of recombinant peptide, Lasioglossin ɪɪɪ, against foodborne pathogens بررسی فعالیت ضد باکتریایی و سمیت پپتید نوترکیب LasioglossinΙΙΙ بر پاتوژن های شاخص مواد غذایی 31 44 2206 10.22103/jab.2018.2206 FA محمد باقر حبیبی نجفی گروه علوم و صنایع غذایی دانشگاه فردوسی مشهد 0000-0002-0498-1067 عباس تنهاییان دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی و به نژادی گیاهی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. پریا رهنما دانشجوی دکتری میکروبیولوژی مواد غذایی، گروه علوم و صنایع غذایی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. مرجان ازغندی دانشجوی دکتری علوم دامی، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. Journal Article 2018 07 13 The increasing microbial resistance to existing antibiotics has increased the interest in novel antimicrobial compounds. Antimicrobial peptides (AMPs) represent an attractive alternative to classical antibiotics. Lasioglossins are a group of peptides with antimicrobial activity. The inhibitory effects of a recombinant synthetic Lasioglossin, Lasioglossin ɪɪɪ, on five food pathogens (Staphylococcus aureus, Salmonella typhimurium, Enterococcus faecalis, Listeria monocytogenes and Escherichia coli) and its cytotoxicity on the normal cell line was investigated in vitro. The findings showed great antimicrobial function of the peptide. Minimum inhibition concentration and minimum bactericidal concentration of Lasioglossin ɪɪɪ on the pathogens were the range of 3.851-8.625 and 7.703-15.406, respectively. Results indicated Staphylococcus aureus showed the highest sensitivity to Lasioglossin ɪɪɪ. The Lassioglossin demonstrated cytotoxic effect on human embryonic kidney cells in higher concentration (1652 µg/ml) in comparison to MIC and MBC values. The results indicate that this peptide can be competed with common antibiotics in terms of the bactericidal properties. افزایش مقاومت میکروارگانیسمها به آنتی بیوتیکهای رایج منجر به یافتن ترکیبات ضد میکروبی جدید شده است. پپتیدهای ضد میکروبی یکی از گزینههای مناسب برای جایگزینی آنتی بیوتیکهای موجود میباشند. لازیوگلوسینها گروهی از پپتیدهای زیست فعال میباشند که در مطالعه حاضر، عملکرد ضد میکروبی پپتید نوترکیب لازیوگلوسین ɪɪɪ بر پنج عامل بیماری‌زای باکتریایی غذایی (باکتری های استافیلوکوکوس اورئوس، سالمونلا تیفی موریوم، انتروکوکوس فکالیس، لیستریا مونوسیتوژنز و اشرشیا کلی) و همچنین بررسی دوز سمیت آن بر یک رده سلول انسانی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حکایت از عملکرد ضد میکروبی مناسب پپتید نوترکیب دارد به صورتیکه حداقل غلظت بازدارندگی(MIC ) و کمترین غلظت کشندگی(MBC) پپتید لازیوگلوسین ɪɪɪ بر باکتری های مورد آزمون به ترتیب در محدوده µg/ml 625/8-851/3 و µg/ml 406/15-703/7 بود. نتایج حاکی از آن بود که باکتری استافیلوکوکوس اورئوس بیشترین حساسیت را به این پپتید دارد به طوری که مقادیر MIC و MBC آن به ترتیب 851/3 و 703/7 بود. غلظتی از پپتید که اثر سمی بر روی سلولهای کلیه جنین انسان نشان داد (1652 µg/ml) به مراتب بیشتر از مقادیر MIC و MBC بدست آمده بود. نتایج این مطالعه نشان داد خاصیت باکتریکشی این پپتید با آنتی بیوتیکهای رایج قابل رقابت میباشد.

https://jab.uk.ac.ir/article_2206_a355a98a013e8209b253bc7ba45bad3d.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Identification of genetic variants in Arian line and investigation of their performance using whole genome sequencing شناسایی واریانت‌های ژنتیکی در لاین‌آرین و بررسی عملکرد آنها با استفاده از توالی‌یابی‌کل ژنوم 45 60 2207 10.22103/jab.2018.2207 FA حامد خراتی‌کوپایی دانشجوی دوره دکتری پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. اسماعیل ابراهیمی شیراز شیراز- کیلومتر12 جاده شیراز اصفهان -منطقه باجگاه- دانشکده کشاورزی - گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشیار پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. محمد دادپسند دانشیار بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. علی نیازی استاد پژوهشکده زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. علی اسمعیلی زاده استاد بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران. Journal Article 2018 04 15 Objective This is the first study for discovering genetic variants in Arian line by whole genome sequencing data. The study of Arian line features at genomic level can unravel the genetic background of economic traits such as growth. Materials and methods In this study, the information of three whole genomes of Arian chickens was used. Results The results of this study indicated that, there were 63866 common variants among samples. 17604 variants Out of 63866 variants were reported as novel variants in this study. Also 604 variants are located in coding regions, which 204 out of them lead to change in the amino acid sequence of the proteins. Considering the importance of dietary protein quality for growth and weight gain for poultry, the results of gene ontology analysis indicated that the pathways of protein catabolism and post-translational modification of proteins, related to growth are considerable. Also candidate genes such as, SMURF2 and SUMO1 was suggested for these biological pathways. Another interesting result of gene ontology was the significance of response to stress pathways. Conclusions In the Arian line due to intense selection, the existence of stress is inevitable. Therefore, the significance of stress response can indicate the importance of these pathways in relation to the desired performance. هدف: مطالعه حاضر، اولین پژوهش برای شناسایی واریانت‌های ژنتیکی در لاین‌ آرین با اطلاعات توالی‌یابی کل ژنوم است. مطالعه خصوصیات لاین‌ آرین در سطح ژنوم، می‌تواند تفاوت‌های ژنتیکی آن را در ارتباط صفات مهم اقتصادی از جمله رشد شرح دهد. مواد و روشها: در این پژوهش، از اطلاعات توالی کل ژنوم سه قطعه مرغ آرین استفاده شد. نتایج: نتایج نشان داد که 63866 واریانت بین نمونه‌ها مشترک است که از این تعداد، 17604 واریانت به عنوان واریانت جدید برای اولین بار در این پژوهش گزارش شدند. همچنین، 604 واریانت در مناطق کدکننده ژنوم وجود دارند که از این تعداد، 204 واریانت منجر به تغییر در نوع آمینواسیدی پروتئین‌ها می‌گردند. با توجه به مهم بودن کیفیت پروتئین جیره برای رشد و افزایش وزن برای طیور، نتایج ژن آنتولوژی نشان داد که مسیر کاتابولیسم پروتئین‌ها و مسیرهای تغییرات پس از ترجمه‌ی پروتئین‌های مرتبط با رشد دارای اهمیتی دوچندان هستند. همچنین، ژن‌های کاندیدایSMURF2 و SUMO1 برای این مسیرهای بیولوژیک پیشنهاد شد. یکی دیگر از نتایج قابل توجه ژن آنتولوژی، معنی‌دار شدن مسیرهای پاسخ به تنش بود. نتیجهگیری: در لاین آرین به دلیل انتخاب شدید برای دستیابی به پیشرفت ژنتیکی بالا در صفات رشد، وجود تنش اجتناب‌ناپذیر است. بنابراین، معنی‌دار شدن مسیرهای پاسخ به تنش، می‌تواند نشان دهنده اهمیت این مسیرها در ارتباط با عملکرد مطلوب باشد.

https://jab.uk.ac.ir/article_2207_45d102956e8ac0f7ccd11319c7e488d6.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Increasing expression of the PR1 gene in quince (Cydonia oblanga) by application of Bion elicitor افزایش بیان ژن دفاعی PR1 در گیاه به (Cydonia oblanga) با کاربرد ماده محرک بیون 61 72 2208 10.22103/jab.2018.2208 FA نسیم سرهنگی دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه پیام نور تهران، تهران، ایران. منصوره کشاورزی دانشیار پژوهشکده میوه های معتدله و سردسیری، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. علی محمد شکیب دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران. محمد علی ابراهیمی دانشیار گروه بیوتکنولوژی، دانشگاه پیام نور تهران، تهران، ایران. Journal Article 2018 02 17 One of the safe methods for fire blight disease management in quince plant (Cydonia oblanga) is through activating plant indigenous defense systems using defense elicitors such as Bion (Benzothiadiazole). Investigating the effect of PR1 defense genes group in induced defense mechanism by Bion in quince was the purpose of this study. For this, RNA was extracted from leaf tissues of bion-sprayed (400 mg/L) and water sprayed (control) plants was used for cDNA synthesis. First, a 750 bp fragment of the actin gene from quince, as a house keeping gene, was cloned and sequenced. The result of sequencing showed it has 99% homology with appleactin gene. Specific primers for quince actin gene were designed and used to study changes in PR1 gene expression in bion-treated comparing control plants using real-time PCR method. Based on the results, Bion treatment caused 10 times increase in the PR1 gene expression. Based of result, the effect of Bion in relative control of fire blight in quince can partly be related to PR1 defense proteins activities. یکی از روشهای سالم مدیریت بیماری آتشک در گیاه به (Cydonia oblanga)، فعال سازی سیستمهای دفاعی درونزاد گیاه با استفاده از مواد محرک دفاعی از جمله بیون(Benzothiadiazole, Bion) است. هدف از این تحقیق، بررسی مکانیسم دفاع القا شده توسط بیون در گیاه به با تاکید بر تغییر بیان ژنهای دفاعی گروه PR1 بود.بدین منظور، ابتدا از برگ گیاهان تیمار که دو نوبت با محلول بیون (400 میلیگرم در لیتر)محلولپاشی شدند و آب (شاهد) RNA استخراج شد و برای ساخت cDNA مورد استفاده قرار گرفت. سپس برای کنترل داخلی، یک قطعه 750 جفت بازی از ژن خانه دار actin همسانه سازی و تعیین توالی شد. نتیجه توالییابی نشان داد که 99% تشابه بین ژن اکتین گیاه به با گیاه سیب(Malus domesticus) وجود دارد. بر اساس آن توالی، آغازگرهای اختصاصی برای گیاه به طراحی و سپس تغییرات ایجاد شده در بیان ژن PR1 پس از تیمار درختان به با بیون توسط real-time PCR بررسی و با شاهد مقایسه شد. نتایج این واکنش نشان داد که تیمار بیون موجب 10 بار افزایش بیان ژن PR1 میشود. بر این اساس، اثر ماده بیون در کنترل نسبی بیماری آتشک میتواند با فعالیت پروتئینهای دفاعی گروه PR1 مرتبط باشد.

https://jab.uk.ac.ir/article_2208_866efde156894e63706763049f0174fe.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Effect of zedo gum - Zataria multiflora essential oil nanoemulsion in the inhibition of free radical intercellular and expression of the NAD(P)H oxidase gene in wheat تاثیر نانوامولسیون صمغ زدو- اسانس آویشن شیرازی در مهار رادیکال‌های آزاد خارج سلولی و بیان ژن‌ NAD (P) H oxidase در گندم 62 86 2209 10.22103/jab.2018.2209 FA فاطمه سهرابی پژوهشکده بیوتکنولوژی ، دانشگاه شیراز غلامرضا کاووسی دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز، شیراز، ایران. Journal Article 2018 04 16 The production of reactive oxygen species, such as hydrogen peroxide is inevitable in aerobic metabolism. Since, these compounds are effective at different concentration in a variety of processes in the cell and their excessive production lead to oxidative stresses, Therefore, their concentration must be controlled. In this study, Zataria multiflora essential oil with abundant phenolic compounds (thymol, carvacrol), and zedo gum polymers were used to encapsulate nanoemulsion production. The effect of zedo gum - Zataria multiflora essential oil nanoemulsion were investigated in the inhibition of ABTS (2,2-azinobis-3-ethylbenzothiazolin-6-sulfonic acid), hydrogen peroxide free radicals intercellular and expression of the (NOX:NAD(P)H oxidase) gene with accession number AY561153 (the largest producer of reactive oxygen species). Nanoemulsion with 88 mg/gr phenol content showed a high ability to inhibit the free radical ABTS and hydrogen peroxide. On the other hand, at concentration of 25 and 50 µg/ml increased the expression of NOX and at concentration of 100, 150 and 200 µg/ml decreased it. Our results showed that, different concentration of nanoemulsion have different effect on reactive oxygen species and, therefore, they have the ability to control oxidative stresses. تولید گونههای فعال اکسیژن به خصوص پراکسید هیدروژن امری اجتناب ناپذیر در متابولیسم هوازی است. از آنجا که این ترکیبات در غلظتهای متفاوت، بر فرآیندهای گوناگونی در سلول موثر هستند و افزایش بیش از حد آنها به تنشهای اکسیدی منجر میشود، کنترل غلظت آنها امری ضروری به نظر میرسد. در این پژوهش از اسانس آویشن شیرازی با ترکیبات فنولی (تیمول، کارواکرول) فراوان و پلیمر صمغ زدو به منظور کپسوله سازی و تولید نانوامولسیون استفاده گردید. تاثیر نانوامولسیون صمغ زدو- اسانس آویشن شیرازی در مهار رادیکالهای آزاد 2،2-آزینوبیس-(3-اتیلبنزوتیازولین-6-سولفونیک اسید (ABTS: 2,2-azinobis-3-ethylbenzothiazolin-6-sulfonic acid) و پراکسیدهیدروژن در خارج از سلول و بیان ژن (NOX: NAD(P)H oxidase) با شماره دسترسی AY561153 (بزرگترین تولید کننده گونههای فعال اکسیژن) مورد بررسی قرار گرفت. نانوامولسیون با محتوای فنول 88 میلیگرم در گرم، توانایی بالایی در مهار رادیکالهای آزاد ABTS و پراکسید هیدروژن از خود نشان داد. از طرفی نانوامولسیون در غلظتهای 25 و 50 میکروگرم در میلیلیتر موجب افزایش و در غلظتهای 100، 150 و 200 میکروگرم در میلیلیتر موجب کاهش بیان ژن NOX گردید. با توجه به نتایج به نظر میرسد نانوامولسیون در غلظتهای متفاوت بر گونههای فعال اکسیژن تاثیر داشته و در نتیجه توانایی کنترل تنشهای اکسیدی را دارا است.

https://jab.uk.ac.ir/article_2209_8c2c06d347298e93e92470776571ff01.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Transcription activator-like effectors (TALEs) role in plant response to Xanthomonas نقش افکتورهای شبه‎فعال‎کننده رونویسی (Transcription Activator-Like Effector, TALE) در تعامل میزبان و بیمارگر Xanthomonas 87 110 2210 10.22103/jab.2018.2210 FA مسعود شمس‎بخش دانشیار، گروه بیماری‎شناسی گیاهی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. نرگس فلاحی چرخابی گروه حشره شناسی و بیماری شناسی گیاهی، پردیس ابوریحان، دنشگاه تهران، پاکدشت، تهران حشمت الله رحیمیان استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران. Journal Article 2018 08 30 Xanthomonas is an important plant pathogenic bacteria and cause economic losses in a wide range of crop plants. The type III secretion system as a crucial pathogenicity factor is used to inject effector proteins into the host cell. Transcription activator like effectors (TALEs), known in the most Xanthomonas species, are DNA-binding proteins which determine solely the outcome of plant-pathogen interaction. Because of determinative nature of TALE-target gene interaction, the knowledge of pathogen TALome diversity, forecasting susceptibility genes, genome editing using new developed methods have provided novel strategies for management of plant diseases. This article reviews TALEs structure, their role in pathogenicity and resistance, as well development of resistant plants to Xanthomonas using TALome derived results. جنس Xanthomonas از باکتری‎های مهم بیمارگر گیاهی است که سبب خسارت اقتصادی در طیف وسیعی از گیاهان میزبان می‎شود. یکی از فاکتورهای اصلی بیماری‎زایی این جنس سیستم ترشحی نوع III است که باکتری‎ها از آن برای انتقال افکتورهای مختلف به گیاه میزبان استفاده‎می‎کنند. افکتورهای شبه‎فعال‎کننده رونویسی (TALE) که در بیشتر زانتوموناس‎ها شناخته‎شده‎اند، پروتئین‎های متصل‎شونده به DNA هستند که با افزایش بیان ژن‎های هدف اغلب به‎تنهایی نتیجه برهم‎کنش میزبان-بیمارگر را مشخص‎می‎کنند. در پرتو ماهیت تعیین‎کننده برهم‎کنش افکتور TAL و ژن هدف آن‎ها، شناخت تالوم (TALome؛ مجموعه افکتورهای شبه‎فعال‎کننده رونویسی یک بیمارگر)، پیش‎بینی ژن‎های حساسیت و ویرایش ژنوم میزبان با استفاده از ابزارهای موجود راه‎کارهای جدیدی برای مدیریت بیماری‎های ناشی از باکتری‎ها را فراهم‎کرده‎است. این مقاله مروری به ساختار، نقش افکتورهای TAL در بیماریزایی و مقاومت و نیز ایجاد ارقام مقاوم به Xanthomonas با استفاده از اطلاعات حاصل از تالوم می‎پردازد.

https://jab.uk.ac.ir/article_2210_63c659e8ee0afab8ea59666b768e8566.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Studying expression of leptin gene in different tissues of Kermani Sheep using Real Time PCR مطالعه بیان ژن لپتین در بافت‌های مختلف گوسفند کرمانی با استفاده از Real Time PCR 111 123 2211 FA محمدرضا محمدآبادی بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان محبوبه کرد دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک واصلاح نژاد دام، دانشگاه شهید باهنر کرمان ، کرمان، ایران. محمود نظری استادیار، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی رامین خوزستان، اهواز، ایران. Journal Article 2018 09 01 Objective Leptin is produced by white adipose tissue and plays an important role in regulation of feed intake, energy balance, fertility and immune functions. Thus, the aim of this research was to study leptin gene expression in adipose tissue, liver, kidney, lung and heart of Kermani sheep. Materials and methods Tissue samples obtained from 6 animals and RNA was extracted. Extracted RNA were immediately stored at -80°C. Quality and quantity of RNA were evaluated and cDNA was synthesized and Real Time PCR was performed. PCR Products were electrophoresed on 1.5% agarose gel and were evaluated different levels of expression in studied different tissues. Results Results showed that the leptin gene was expressed in all the tested tissues and the highest level of expression was observed in adipose tissue and liver and the lowest level was detected in heart. Conclusions These results may show that leptin plays a particular role in fat metabolism. Further studies are needed to clarify role of leptin in the physiology of fat metabolism and other materials. This would help us to better understand the mechanisms for the known effect of nutritional factors and body fatness on various functions. هدف: لپتین به وسیله بافت چربی سفید تولید میشود و نقش مهمی در تنظیم مصرف غذا، تعادل انرژی، باروری و فعالیتهای ایمنی بازی میکند. لذا، هدف از این پژوهش، مطالعه بیان ژن لپتین در بافتهای چربی، کبد، کلیه، شش و قلب در گوسفند کرمانی بود. مواد و روشها: از بافتهای شش گوسفند کرمانی نمونه برداری و RNA استخراج شد. RNA استخراج شده در دمای منفی80 درجه سانتیگراد نگهداری شد. کیفیت و کمیت RNA بررسی و سنتز cDNAانجام شد. واکنش Real Time PCR برای ژن لپتین و بتااکتین صورت گرفت. محصولات PCR روی ژل آگارز 5/1 درصد نیز الکتروفورز شد و سطوح مختلف بیان در بافت های ذکر شده، مورد بررسی قرار گرفت. نتایج: نتایج حاصل از این بررسی نشان داد که این ژن در تمامی بافت های بررسی شده بیان شده است و بیشترین سطح بیان در بافت چربی و کبد و کمترین سطح بیان در بافت های قلب مشاهده شد. نتیجه گیری: این نتایج میتواند نشان دهنده این امر باشد که لپتین در متابولیسم چربی نقش ویژهای دارد. مطالعات بیشتری باید انجام شود تا نقش لپتین در فیزیولوژی ساخت و متابولیسم چربی و مواد دیگر مشخص شود. این امر کمک خواهد کرد تا مکانیسمهایی برای شناخت اثر فاکتورهای تغذیهای و چربیهای بدن در فرآیندهای مختلف درک شوند.

https://jab.uk.ac.ir/article_2211_4af8e68eb17eda1326cb724e7837e9be.pdf

دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایران مجله بیوتکنولوژی کشاورزی 2228-6705 10 3 2018 12 22 Identification and molecular characterization of the phytoplasma associated with leaf stunting and yellowing disease in Razavi and North Khorasan provinces شناسایی و تعیین ویژگی‌های مولکولی فیتوپلاسمای همراه زردی و ریز برگی هلو در استان‌های خراسان رضوی و شمالی 124 131 2212 10.22103/jab.2018.2212 FA سعید طریقی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد مجتبی دهقان نیری دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. عبادالله عبادی دانشجوی دکتری بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران. Journal Article 2018 07 03 In 2017, leaf stunting and yellowing were observed on twigs and branches of stone fruit trees in production regions in Razavi and North Khorasan provinces of Iran. For diagnosis of disease and identification of the causal agent, symptomatic leaf samples were collected in these orchards and were carried to the laboratory. The disease agent was successfully transmitted by grafting from naturally symptomatic samples to peach (Prunus persica) seedlings. Total DNA was extracted from plant samples and indexed by nested PCR using phytoplasma generic primers, P1/P7 and R16F2n/R2. PCR products were sequenced and the nucleotide sequences were compared with those of other phytoplasmas in GenBank and analyzed by virtual restriction fragment length polymorphism (RFLP). The phytoplasmas associated with leaf stunting and yellowing disease in Razavi and North Khorasan provinces were identiﬁed as members of the 16SrIX group or Pigeon pea witches broom (Candidatus Phytoplasma phoenicium). This is the first report of leaf stunting and yellowing disease and characterization of associated phytoplasma in these regions. در بازدیدهای تابستان 1396 از باغات درختان میوه در استانهای خراسان رضوی و شمالی، علائم زردی و ریز برگی در درختان هلو در سطح باغات دیده شد. نمونههای دارای علائم فوق از باغات جمعآوری و برای شناسایی عامل بیماری به آزمایشگاه منتقل شدند. عامل بیماری به وسیله پیوند به نهالهای سالم هلو انتقال یافت و در گیاه مایهزنی شده با پیوند، علائم زردی و ریز برگی مشاهده شد. ردیابی عامل بیماری توسط آزمونهای دو مرحلهای PCR با جفت آغازگرهای P1/P7 (دور اول) و R16F2n/R16R2 (دور دوم) صورت گرفت. قطعههای حدود 1250 جفت بازی حاصل از PCR دو مرحلهای توالییابی شدند. مقایسه توالیهای به دست آمده با توالیهای موجود در NCBI توسط نرم افزار BLAST و بررسی چندشکلی طولی قطعات برشی مجازی ناحیه تکثیر شده، نشان داد که فیتوپلاسمای همراه با زردی هلو در استانهای خراسان رضوی و شمالی شباهت بالایی با Candidatus Phytoplasma phoenicium مربوط به گروه جاروک نخود کبوتر (Pigeon pea witches broom) یا 16SrIX آر ان ای ریبوزومی دارند. این اولین گزارش از بیماری زردی و ریز برگی هلو و تعیین ویژگیهای فیتوپلاسمای همراه با آن در این مناطق میباشد.

https://jab.uk.ac.ir/article_2212_d07ec33267d5a058668f6c892b2ba0e7.pdf