دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Genetic diversity of Iranian populations of Septoria tritici using RAPD analysisبررسی تنوع ژنتیکی جدایه های ایرانی Septoria tritici با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD116115410.22103/jab.2010.1154FAمریمدارستانی فراهانیناصرصفاییعزیزالهعلیزادهJournal Article20091004<em>Septoria</em> leaf blotch is one of the most important wheat diseases worldwide including Iran. To study the genetic diversity of Iranian isolates of <em>Septoria tritici</em>, the infected samples were collected from Khuzestan, Golestan, Ardebil and Kermanshah provinces. Twenty six out of 88 recovered isolates were selected according to their geographical origins for studying virulence and their genetic diversity using RAPD analysis. Analysis of virulence of disease severity data was statistically significant at 99% confidence level (p<0.01). Comparison of the means of disease severity, using Duncan’s multiple range test, divided the isolates into five groups. In genetic diversity studies, Six out of 15 random primers were polymorphic and reproducible. Cluster analysis of DNA fingerprint data using UPGMA method and Jaccard's coefficient, divided the isolates into 8 groups at 35% similarity level showing a high genetic diversity among Iranian populations of <em>S. tritici</em>. According to number of clusters in which the isolates of each region were placed, the highest genetic diversity belonged to Ardebil. This is the first report on the study of genetic diversity of Iranian populations of <em>S. tritici</em>. بیماری سپتوریوز برگی گندم از مهمترین بیماریهای گندم در جهان و ایران میباشد که سالیانه خسارت فراوانی را به محصول گندم وارد میسازد. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای ایرانی <em>Septoria tritici</em>،<em> </em>نمونههای گندم آلوده از چهار استان خوزستان، گلستان، اردبیل و کرمانشاه جمع آوری و بررسی شد. از میان 88 جدایه بدست آمده، 26 جدایه بر اساس پراکنش جغرافیایی برای مطالعات بیماریزایی و بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر RAPD انتخاب شدند. تجزیه واریانس شدت بیماریزایی جدایه ها در سطح 99 درصد (p<0.01) معنی دار بود و براساس مقایسه میانگین شدت بیماریزایی جدایه ها با استفاده از آزمون دانکن به 5 گروه تقسیم شدند. در مطالعه تنوع ژنتیکی، از میان 15 آغازگر تصادفی بررسی شده، شش آغازگر شامل؛ OPC18 ، P14 ، RC09 ، R28 ، OPA04 ، Rotha14 بر اساس وضوح باند و تکرار پذیری انتخاب شدند. تجزیه و تحلیل خوشهای دادههای حاصل از الگوی باندی مربوط به این شش آغازگر تصادفی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و روش UPGMA جدایههای <em>Septoria tritici</em> مورد بررسی را در سطح تشابه 35 درصد، به 8 گروه تقسیم نمود که بیانگر تنوع ژنتیکی بالا در این جدایهها می باشد و بر اساس تعداد کلاسترهای مربوط به جدایه ها، در منطقه اردبیل با 3/36 درصد بیشترین تنوع را نشان داد. این اولین گزارش از بررسی تنوع ژنتیکی در جدایههای <em>S. tritici</em> در ایران است.دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Molecular identification of apple cultivars/rootstocks using SSR markersشناسایی ملکولی تعدادی از ارقام و پایه های سیب توسط نشانگر SSR1726115510.22103/jab.2010.1155FAرومیناجهرمی شیرازیمنصورهکشاورزیمحمدرضانقویJournal Article20090918Identification of plant cultivars and rootstocks, requires accurate and reproducible methods which not affected by environmental conditions. In this research, efficacy of SSR markers in identification of some apple genotypes and rootstocks was studied. For this purpose, 5 pairs of SSR markers were applied for identification of 24 and 5 Iranian and foreign apple genotypes and rootstocks, respectively. According to the results, 52 polymorphic alleles were proliferated in 5 microsatellite loci (mean 10.4 alleles per locus) and polymorphism information content (PIC) was 80%. The markers produced specific DNA bands in "Lobnani (tabestane)", "Golab (Damavand)", "Golab (Isfahan)", "Malyer 8" and "Malayer 9" genotypes and specific band patterns in "Bahare arak", "Shemirani", "Lobnani (tabestane) ", "Damavand B1", "Golabn (rasmi) ", "Golab (damavnd) ", "Golab (sahne) ", "Malayer 8", "Malayer 6", "Malayer 9", "Shafiabadi (chalus) and "Golab (paize) ". In rootstocks, 12 specific and reproducible alleles were identified. The results indicate the high efficacy of SSR markers for apple cultivar and rootstock identification.شناسایی ارقام و پایه های گیاهی نیازمند دسترسی به روش هایی است که دقیق و تکرار پذیر بوده و از شرایط محیطی متأثر نشوند. در این پژوهش کارایی نشانگر ملکولی ریزماهواره (SSR) در شناسایی ارقام و پایه های سیب، مورد بررسی قرار گرفت. بدین منظور از 5 جفت نشانگر منتخب ریزماهواره برای شناسایی 24 ژنوتیپ و 5 پایه بومی و خارجی سیب استفاده شد. بر اساس نتایج، در مجموع 52 آلل چند شکل در 5 مکان ژنی ریزماهواره (میانگین 4/10 آلل در هر مکان ژنی) شناسایی شد و میانگین محتوی اطلاعات چند شکلی (PIC) آنها 80/0 بود. نشانگرهای مورد استفاده در ژنوتیپ های لبنانی تابستانه، گلاب دماوند، گلاب اصفهان، ملایر 8 و ملایر 9 نوارهای اختصاصی و در ژنوتیپ های بهاره اراک، شمیرانی، لبنانی تابستانه، دماوند B<sub>1</sub>، گلاب رسمی، گلاب دماوند، گلاب صحنه، ملایر 6، ملایر 8، ملایر 9، شفیع آبادی چالوس و گلاب پائیزه الگوی نواربندی اختصاصی ایجاد کردند. با استفاده از این نشانگرها، 12 آلل اختصاصی واضح و تکرار پذیر در 5 پایه مورد بررسی، شناسایی شد. نتایج، بیانگر کارایی بالای نشانگر ریزماهواره در شناسایی ارقام و پایه های سیب استدانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220A study on the growth and secondary metabolite production in the soft coral Sinularia flexibilis for biotechnological exploitationsبررسی رشد و تولید متابولیتهای ثانویه با خواص دارویی در مرجان نرم همزیست Sinularia flexibilis2738115610.22103/jab.2010.1156FAمحمد کاظمخالصیJournal Article20100316Sessile marine invertebrates produce toxins to deter or kill predators and competitors. In recent years, biomedical exploitation of these bioproducts, organism availability for mass production, and limited stock in their natural habitats have been serious obstacles hindering benefit from these organisms. Cultivation of these invertebrates, is one of various approaches for producing the large biomass required. In this report, results of a preliminary study on the captive symbiotic soft coral <em>Sinularia flexibilis</em>, the richest species within its genus, are presented. Using asexual propagation of this species, fragments of the coral were established in a cultivation tank. These coral samples showed absolute survival (100%, n=24) within 16 weeks, high specific growth rates (17-21×10<sup>−</sup><sup>3</sup>d<sup>−</sup><sup>1</sup>), and a minimum doubling time of 6 weeks in the laboratory. In addition, biosynthesis of major bioactive compound of this species, flexibilide, continued in a range of 0.1-0.25 mg g<sup>−</sup><sup>1</sup> dry weight. Considering high potential of the Iranian southern waters and the diversity of similar marine organisms, it is important to apply marine biotechnology for substantial exploitation of these potential resources.
بیمهرگان دریایی که به بستر میچسبند برای دفاع و سایر واکنشهای ایمنی، از خود مواد سمی ترشح میکنند. در سالهای اخیر، بهدلیل استفاده زیستی و پزشکی از تولیدات این بیمهرگان، لزوم دسترسی به تولید انبوه آنها، و موجودی محدود آنها در زیستگاههای طبیعی بهرهبرداری پایدار از تولیدات مفیدشان را با مشکل جدی مواجه ساختهاند. از جمله راهکارهای گوناگون برای تولید انبوه این بیمهرگان، امکان پرورش گونههای مختلف و چگونگی تولید سموم یا همان متابولیتهای ثانویه آنها میباشد. در مقاله حاضر، نتایج اولیه پژوهش روی مرجان نرم همزیست گونۀ <em>Sinularia flexibilis</em> به عنوان غنیترین گونه در جنس خود، در محیط آزمایشگاهی ارائه میگردد. با استفاده از مزیت افزایش غالب این گونه بهروش غیرجنسی قلمه زدن، قلمههایی از مرجان مذکور تهیه و در تانکهای پرورشی قرار داده شدند. با فراهم بودن کمترین شرایط محیطی یعنی نور و جریان آب و بدون تغذیه دستی، بازماندگی بالا (100%) و رشد ویژه فزاینده (<sup>٣</sup><sup>−</sup>١٠×٢١-17 در روز) به مدت 16 هفته، با زمان دو برابرشدگی حداقل 6 هفته در قلمههای مرجان مشاهده شد. همچنین تولید متابولیت ثانویه عمده با نام فلکسی بیلاید در این گونه مرجان با غلظت 25/0≈-1/0≈ میلیگرم در گرم وزن خشک قلمهها ادامه یافت. با بهرهگیری از نتایج این پژوهش و با توجه به پتانسیل بالا و تنوع آبزیان مشابه در آبهای جنوب ایران، اهمیت زیست فناوری دریایی در بهرهبرداری پایدار از این منابع بالقوه مفید آشکار میگردد.
دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Changes in chitinase and β-1,3-glucanase transcript levels in sweet orange (Citrus sinensis) in response to treatment with Xanthomonas citri subsp. Citriبررسی تغییرات رونوشت های دو ژن کیتیناز و بتا 1 و 3 گلوکاناز در نهال های پرتقال (Citrus sinensis)در پاسخ به آلودگی باکتری عامل شانکر مرکبات3952115710.22103/jab.2010.1157FAمهدیمنصوری0000-0002-5222-8870اکبرحسینی پورغلامرضاشریفی سیرچیحسینمعصومیJournal Article20090911Asiatic citrus canker caused by <em>Xanthomonas citri</em> subsp. <em>citri</em> is a bacterial disease with economic importance in tropical and subtropical citrus-producing areas. One of the potential reaction of plants to pathogens attack is an increased levels of pathogenesis-related proteins such as chitinase and β - 1,3 -glucanase. The objective of present study was to investigate the expression of the PR proteins; β-1,3-glucanase and chitinase in Washington Navel orange (<em>Citrus sinensis</em>) inoculated with <em>Xanthomonas citri</em> sub sp.<em>citri</em>. Quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction was used to quantify the mRNA level of chitinase and ß- 1,3 -glucanase genes in early stage of plant defense response. For this purpose, total RNA was extracted from inoculated and non inoculated citrus plants at<em> </em><em>different times</em><em> </em>post<em>-</em><em>inoculation</em><em>. </em><em>Higher</em> amounts of <em>transcripts were</em><em> </em>detected 24 hours after pathogen inoculation of citrus leaves and four-fold more than the control citrus plant. The transcript levels of the two genes were reduced with the time after inoculation, and decreased significantly at 96 hours post inoculation. This study indicated that the role of chitinase gene is more than glucanase in early stage of citrus canker disease.<em></em>شانکر باکتریایی مرکبات با عامل ((<em>Xanthomonas citri</em> subsp. <em>citri</em> یکی از مهمترین بیماری های مرکبات در مناطق گرمسیر و نیمه گرمسیر محسوب می شود. تجمع پروتئین های مرتبط با بیماریزایی نظیر کیتیناز و گلوکاناز در اثر حمله عوامل بیمارگر گیاهی، یکی از مکانیسم های دفاعی گیاهان در مقابل عوامل بیماریزا محسوب می شود. به منظور بررسی و مقایسه میزان mRNA دو ژن کیتیناز و گلوکاناز در مراحل اولیه آلودگی نهال های پرتقال (رقم واشنگتن ناول) به باکتری عامل بیماری شانکر مرکبات از روش Real time RT-PCR استفاده گردید. پس از آلوده نمودن برگهای پرتقال با باکتری <em>X. citri</em> subsp. <em>citri</em> ، در زمان های مختلف RNA کل استخراج و پس از سنتز cDNA، تغییرات میزان بیان ژن های مذکور اندازه گیری شد. نتایج نشان داد پس از 24 ساعت از زمان مایه زنی، میزان cDNA نسخ این دو ژن چهار برابر شاهد (برگ های پرتقال تزریق شده با آب سترون) بود و پس از گذشت 96 ساعت این میزان به طور معنی دار (p<0.0001) کاهش یافت. نتایج این تحقیق نشان می دهد که مقدار تغییرات ژن کیتیناز نسبت به ژن گلوکاناز بیشتر است و این ژن در مراحل اولیه فرایند برهمکنش باکتری با گیاه نقش بیشتری دارد.دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Molecular Analysis of Mazandrani native chicken population based on HVR-I region of Mitochondrial DNAتجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ بومی مازندران با استفاده از توالی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری5366115810.22103/jab.2010.1158FAنصراللهپیرانیشهرکرد شهرکرد ابتدای جاده سامان دانشگاه شهرکرد دانشکده کشاورزی گروه علوم دامیآرزومحمدهاشمیگروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی،دانشگاه مشهدصادقعلیجانیگروه علوم دامی دانشکده کشاورزری دانشگاه تبریزرامینرضازاده گلیگروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی،دانشگاه تبریزصابرقنبریدانشگاه گوتنینگن آلمانJournal Article20091013Reserving genetic diversity in native chicken breeds of Iran because of little population size is necessary for breeding goals and increasing their production. The first step is determination of genetic diversity in existing populations. Studying mitochondrial HVR-I can give useful information about genetic diversity in those populations. This study was carried out for determination of the mitochondrial HVR-I sequence in Mazandarani native chicken in Iran, estimation of genetic diversity and determining its phylogenetic relationship with other chicken breeds. Blood samples were taken randomly from 20 birds. After extracting DNA, HVR-I region was amplified with specific primers and after purification was sequenced. From 20 primary sequences, 19 were sequenced properly. The phylogenic tree was drawn with consensus sequence of Mazandarani breed and other similar sequences of different chicken breeds obtained from GenBank. In the phylogenic tree, the Mazandarani breed was clustered with Iranian Marandi native chicken, Azarbayjan native, white Leghorn, Barred Plymouth rock, Silky and Sonerati breeds. Then, it can be concluded that Mazandarani breed has some genetic similarities with these chicken breeds.حفظ تنوع ژنتیکی در جمعیتهای بومی مرغ در نقاط مختلف ایران به دلیل اندازه کم جمعیت آنان برای انجام برنامههای اصلاح نژادی و افزایش تولید ضروری است. اولین گام در این راه تعیین تنوع ژنتیکی در این جمعیتها است. بررسی توالی ناحیه HVR-I ژنوم میوکندری میتواند شاخصی مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیتهای مورد بررسی ارائه دهد. هدف از این تحقیق تعیین توالی ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری جمعیتی از مرغ مازندرانی ایران، تعیین میزان تنوع موجود در این جمعیت و ترسیم رابطه فیلوژنی آن با سایر نژادهای مرغ بود. به این منظور از تعداد 20 قطعه مرغ مازندرانی به طور تصادفی خونگیری انجام شد. پس از استخراج DNA از خون کامل، ناحیه HVR-I با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و قطعات تکثیر شده پس خالص سازی توالی یابی شدند. در کل 19 توالی با کیفیت مناسب بدست آمد. پس از اخذ توالیهای مشابه ژنوم میتوکندری دیگر نژادهای موجود در بانک جهانی ژن و مرغ مرندی ایران درخت فیلوژنی با استفاده از آنها ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که مرغ بومی مازندرانی ایران با مرغ مرندی ایران، بومی کشور آذربایجان، لگهورن سفید، پلیموتراک پر خطدار، مرغ ابریشمی و جنگلی خاکستری (سونراتی) در یک دسته قرار دارند. بنابراین، میتوان نتیجهگیری کرد که مرغ مازندرانی احتمالا" واجد برخی شباهتهای ژنتیکی با این نژادها میباشد.دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Gene expression analysis of OsPP2C5, a candidate protein phosphatase involved in ABA signal transduction, under salt, drought and cold stress in riceبررسی بیان ژن OsPP2C5، در شرایط تنشهای غیر زنده (شوری، خشکی و سرما) در برنج6778115910.22103/jab.2010.1159FAسودهتیرناززهراساداتشبرقاسممحمدی نژادغلامحسینشهیدی بنجارJournal Article20090921Protein phosphatase 2C family consists of a group of evolutionary conserved serine/threonine phosphatases which play a role in stress signal transduction. A subfamily of these protein phosphatases in Arabidopsis, including ABI1 and ABI2, are known as components of ABA signal transduction pathway. Nine OsPP2C proteins were found in rice (<em>OsPP2C1</em> to <em>OsPP2C9</em>), carrying all the conserved motifs of this subfamily. Among them, only<em> OsPP2C5</em> transcript levels were significantly up-regulated by drought and abscisic acid which is down-regulated by re-watering or ABA removal. In this research, we investigated the effect of drought (180 mM mannitol), salt (100 mM NaCl) and cold (15°C) stresses on <em>OsPP2C5</em> gene expression in 2-days-old seedlings of FL478, IR29 by semi quantitative RT-PCR and Real time PCR methods. The expression levels of <em>OsPP2C5</em> gene in both cultivars were upregulated by cold and drought stresses compared to control and salt treatment. Three alternative transcripts were identified based on the achieved results by semi quantitative RT-PCR and the alignment of the reported sequences for <em>OsPP2C5</em> gene including cDNA and ESTs. The expression of two transcripts amplifiable by the used primers in semi quantitative RT-PCR method were detected in both cultivars while the transcript levels of the bigger transcript was more in IR29 and the transcript levels of the smaller one (original transcript) was higher in FL478 (under drought and cold stress). It seems the transcript type and the expression level is correlated with the cultivar sensitivity to the respected stress.پروتئین فسفاتازهای C2، گروهی از سرین/ترئونین فسفاتازها هستند که در ترارسانی پیام تنش نقش دارند. زیرخانوادهای از این پروتئین فسفاتازها در آرابیداپسیس، شامل ABI1 و ABI2، به عنوان جزئی از مسیر ترارسانی پیام اسیدآبسیزیک شناختهشدهاند. نه پروتئین در برنج شناسایی شدهاند، که دارای تمامی نواحی حفظ شده زیرخانواده مذکور هستند، تنها میزان بیان رونوشتهای<em> </em><em>OsPP2C5</em> به شدت تحت تأثیر تنش خشکی و هورمون آبسیزیکاسید افزایش و با آبیاری مجدد یا حذف<em> </em>اسیدآبسیزیک کاهش مییابد. در این پژوهش، الگوی بیان ژن<em>OsPP2C5 </em> تحت تنشهای شوری (١٠٠ میلی مولار نمک (NaCl))، خشکی (١٨۰ میلیمولار مانیتول) و سرما (١٥ درجه سانتیگراد) در دانه رستهای دو روزه لاین های IR29 وFL478 (به ترتیب مرجع حساسیت و تحمل به شوری) با استفاده از روشهای رونویسی معکوس- واکنش زنجیرهای پلیمراز (RT-PCR) نیمهکمی و واکنش زنجیرهای پلیمراز در زمان واقعی (Real-time PCR) بررسی شد. میزان بیان ژن<em> </em><em> OsPP2C5</em>در دانه رستهای هر دو لاینIR29 و FL478 در تنشهای خشکی و سرما نسبت به تیمارهای شوری و شاهد افزایش یافت. بر اساس نتایج به دست آمده از روش RT-PCR نیمهکمی و همردیفی توالیهای گزارش شده برای ژن مورد نظر در بانک ژن، سه رونوشت برای این ژن شناسایی شد. بیان دو رونوشت قابل تکثیر با آغازگرهای مورد استفاده در روشRT- PCR نیمهکمی در هر دو لاین مشاهده شد، اما میزان بیان رونوشت بزرگتر در لاین IR29 و میزان رونوشت کوچکتر (رونوشت اصلی) در لاین FL478 (در شرایط خشکی و سرما) بیشتر بود. به نظر میرسد نوع رونوشت و سطح بیان با میزان حساسیت لاین به تنش مورد بررسی، مرتبط است.دانشگاه شهید باهنر کرمان (دانشکده کشاورزی و پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی) و انجمن بیوتکنولوژی جمهوری اسلامی ایرانمجله بیوتکنولوژی کشاورزی2228-67051220100220Comparison of Genetic and Morpho-physiological Distance via SDS-PAGE Marker in Some Rapeseed Genotypesمقایسه فاصله ژنتیکی و مورفوفیزیولوژیکی برخی از ژنوتیپهای کلزا بر اساس نشانگر SDS-PAGE7994116010.22103/jab.2010.1160FAمهدیکاکاییعلیرضازبرجدی0000-0002-7091-3847علیمصطفاییJournal Article20090927Oilseed crops such as rapeseed have the important role in the production of energy for humans. The most important part of plant breeding programs understanding of genetic diversity to classify population based on different markers for selecting the suitable parents. In this research, genetic diversity of 16 genotypes of rapeseed was evaluated using SDS-PAGE protein markers and morpho-physiological traits in the field and laboratory conditions. Extraction of leaf proteins was performed before physiological maturity and then concentration of proteins was measured by Bradford method. For separating and patterning of the extracted proteins, SDS-PAGE technique via poly acrylamide electrophoresis was used. After staining of proteins by coomassie blue R-250 and scoring of the bands, cluster analysis was computed based on Jaccard coefficient which that the genotypes classified into 2 separate groups. Results of cluster analysis based on agronomical traits shown that the studied genotypes classified into 5 groups. Correlation between morphological and molecular traits was assessed using Mantel test and significant positive correlation was observed between them. Thus according to genetic distances between the genotypes, we can use cross between Milena and Dante for obtain the highest amount of heterosis in future breeding program and hybridization between Opera and Sahara based on morpho-physiological markers according to similarity coefficient is justified.
گیاهان دانه روغنی نظیر کلزا نقش مهمی در تولید انرژی برای انسان دارند. اطلاع از تنوع ژنتیکی بر پایه نشانگرهای گوناگون در برنامههای بهنژادی، و از جمله انتخاب والدین نقش مهمی دارد. در تحقیق حاضر، تنوع ژنتیکی 16 ژنوتیپ کلزا به کمک نشانگر پروتئینی SDS-PAGE و صفات مورفوفیزیولوژیکی در شرایط مزرعه و آزمایشگاه مورد ارزیابی قرار گرفت. استخراج پروتئینهای برگ در مرحله قبل از رسیدگی فیزیولوژیکی انجام شد و غلظت پروتئینها توسط روش برادفورد تعیین گردید. سپس برای تفکیک پروتئینهای استخراجی، از روش الکتروفورز ژل پلیاکریل آمید در حضور سدیم دو دسیل سولفات استفاده شد. پس از رنگآمیزی ژل پلیاکریل آمید با کوماسی بلو R-250 و امتیازدهی باندها، تجزیه خوشهای بر اساس ضریب تشابه جاکارد انجام شد و بر این اساس ژنوتیپها در دو کلاس مجزا قرار گرفتند. نتایج حاصل از تجزیه خوشهای بر مبنای صفات مورفوفیزیولوژیکی نشان داد که ژنوتیپهای مورد مطالعه در 5 گروه قرار میگیرند. به منظور تعیین همبستگی بین صفات مورفوفیزیولوژیکی و ملکولی از آزمون مانتل استفاده گردید و همبستگی معنیداری بین صفات مورفوفیزیولوژیکی و دادههای ملکولی مشاهده شد. بنابراین، با توجه به فواصل ژنتیکی ژنوتیپها نسبت به هم، در برنامههای بهنژادی برای بدست آوردن بالاترین مقدار هتروزیس، تلاقی ژنوتیپهایMilena و Operaو نیز ژنوتیپهایDante با Sahara با توجه ضرایب تشابه نشانگرهای مورفوفیزیولوژیکی قابل توجیه است.