مطالعه تنوع ژنتیکی و گروه های جغرافیایی برخی از ارقام و ژنوتیپ های زردآلو با استفاده از نشانگرAFLP

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی ارشد، بخش زراعت و اصلاح نبات، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

2 استادیار بخش ژنومیکس، انستیتو تحقیقاتی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

3 استادیار مرکز تحقیقات کشاورزی آذربایجان شرقی

4 استادیار بخش زراعت و اصلاح نبات، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری

5 دانشیار بخش ژنومیکس، انستیتو تحقیقاتی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

6 دانشجوی کارشناسی ارشد، بخش ژنومیکس، انستیتو تحقیقاتی بیوتکنولوژی کشاورزی ایران

چکیده

زردآلو با نام علمی (Prunus armeniaca L.) متعلق به خانواده رزاسه است که بومی مناطق مدیترانه و آسیای میانه به ویژه ایران می باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی تنوع ژنتیکی و ساختار ژنتیکی ارقام و ژنوتیپ های زردآلو بر اساس منشا جغرافیایی آنها می باشد. بر این اساس تنوع ژنتیکی 42 رقم و ژنوتیپ زردآلوی موجود در کلکسیون های سهند تبریز و باغ گیاهشناسی دانشکده باغبانی لدنیسه جمهوری چک، با استفاده از نشانگرهای AFLP نشاندار با فلورسنت ارزیابی شد. در ابتدا 30 ترکیب پرایمر انتخابی بر اساس ترکیب پرایمری موجود روی 42 نمونه زردآلو مورد آزمایش قرار گرفت که 5 ترکیب پرایمری با بیشترین مقدار چندشکلی و الگوی باندی واضح، در ادامه پژوهش مورد استفاده قرار گرفتند. تعداد کل باندهای محاسبه شده توسط این 5 پرایمر 187 بود که پرایمر MGAG/ETG با مقدار چندشکلی برابر با 1/63% بیشترین میزان چندشکلی و پرایمر MTTT/ETG با چندشکلی برابر با 9/53 % کمترین مقدار را نشان دادند. نتایج این پژوهش نشان داد ارقام و ژنوتیپ های زردآلو موجود در کلکسیون های ایران و چک بر اساس منشا و پراکندگی جغرافیایی در گروهبندی های مجزایی قرار می گیرند. بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت بین ارقام و ژنوتیپ های زردآلوی مورد مطالعه و حتی دیگر گونه های Prunus با استفاده از ترکیب نشانگرهای AFLP نشاندار در مقایسه با روش متداول AFLP نتایج کارآمدتری را نشان داد

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Study of genetic diversity and eco-geographic groups in some apricot cultivars and genotypes using flurescent-AFLP markers

نویسندگان [English]

  • Parastoo Majidian 1
  • Mehrshad Zeinolabedini 2
  • Jalil Degam poor 3
  • Hamid Najafi 4
  • Mohssen Mardi 5
  • Mohsen Dabab 6
  • Maryam Farsi 6
چکیده [English]

Apricot (Prunus armenica L.), a fruit species of the family Rosaceae, genus Prunus is widely distributed in the Mediterranean region and the Middle East, especially in Iran. Suitable climatic conditions for apricot production and its economic importance were the main reasons for its vast area under cultivation and diversity. Genetic diversity of 42 apricot cultivars and genotypes collected from new Iranian and Czech Republic collections was studied using fluorescent-AFLP markers. The objectives of this study were to determine the genetic structure and genotypic diversity among different eco-geographical populations. The results showed that five pairs of fluorescent-AFLP primers showed clear banding patterns and high level of polymorphism amongst the 30 pairs of primers screened. The total bands were 187 and MGAG ETG primer showed 63% polymorphism among primers that was the highest quantity of polymorphism. Based on the application of genotypes from breeding programs, Hybridization and selection, there were not appropriate results from UPGMA method. We used RB method to analyze the relationship among samples. Six groups of cultivars and genotypes were detected based on their origin and geographical distribution. Our findings showed that in comparison with traditional AFLP, fluorescent-AFLP markers are more efficient in evaluating genetic diversity and population structure among studied apricot genotypes and could be useful in other Prunus fruit tree species

کلیدواژه‌ها [English]

  • Apricot
  • fluorescent AFLP-markers
  • polymorphism
  • genetic diversity

اصل مقاله

:  Apricot, fluorescent AFLP-markers, polymorphism, genetic diversity

مراجع

Badenes ML, Martínez-Calvo J, Llàcer G (1998). Analysis of apricot germplasm from the European ecogeographical group. Euphytica 102: 93-99.
Bailey CH, Hough LF (1975). Apricots. In: Janick, J, Moore JN (eds), Advances in Fruit Breeding. Purdue University Press. Indiana. pp. 367-386.
Byrne DH, Littleton TG (1989). Characterization of isozyme variability in apricots. Journal of the American Society for Horticulture Science 114: 674-678.
Faust M, Surànyi D, Nyujtó F (1998). Origin and dissemination of apricot. Horticultural Review 22:225-266.
Hagen LS, Khadari B, Lambert P, Audergon JM (2002). Genetic diversity in apricot revealed by AFLP markers: species and cultivar comparisons. Theoretical and Applied Genetics 105:298-305.
Mehlenbacher SA, Cociu V, Hough LF (1991). Apricots (Prunus). In: Moore, J.N., J.R. Ballington (eds) Genetic Resources of Temprate Fruit and Nut Crops. International Society for Horticultural Science 65-107.
Pashkoulov D, Givondov A, Yliev P (1995). Isozyme variability in plum (Prunus- domestica), and its use for cultivar and interspecific hybrid identification. Biotechnology & Biotechnological Equipment 9:33-35.
Rasmussen M, Karypis G (2004). gCLUTO- an interactive clustering, visualization, and analysis system. CSE/LIMN Technical Report no. TR 04-021.
Sharifi Tehrani M, Mardi M, Sahebi J, Catalan, P, Diaz-Perez A (2009). Genetic diversity and structure among Iranian tall fescue populations based on genomic-SSR and EST-SSR marker analysis. Plant System and Evolution 282:57-70.
Tarkesh Esfahani S, Shiran B, Balali G (2009). AFLP markers for the assessment of genetic diversity in european and North American potato varieties cultivated in Iran. Crop Breeding and Applied Biotechnology 9: 75-86.
Zhaohe Y, Xuesen C, Tianming H, Jianrong F, Tao F, Chunyu Z (2007). Population Genetic Structure in Apricot (Prunus armeniaca L.) cultivars revealed by Fluorescent-AFLP markers in southern Xinjiang, China. Journal of Genetics and Genomics 34:1037-1047.
 
 
 
 
 
 
 
مجله بیوتکنولوژی کشاورزی
دوره 3، شماره 1 - شماره پیاپی 1
سال1 شماره 3 بهارو تابستان 1390
خرداد 1390
صفحه 67-76

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار